后来王重阳自然也明白了，但他于邦国之仇总是难以忘怀，常说：匈奴未灭，何以为家？对林朝英的深情厚意，装痴乔呆，只作不知。林朝英只道重阳瞧她不起，怨愤无已。
两人本已化敌为友，后来却又因爱成仇，斗智斗力，最终林朝英巧计逼他出家入道，由此创立名动天下的全真教。
可惜王重阳学究天人，武功冠绝天下，但却不怎么教徒弟，他座下的全真七子不仅武功平平，教出来的徒弟差点毁了把他的一世英名。
尹志平修持不定，放纵欲望玷污小龙女清白，最终害人害己，赵志敬为一己私欲勾结蒙古人，不仅害死了无数全真精英弟子，还招来蒙古大军齐攻重阳宫，全真七子为保全真道统不被灭绝，商议之下，决定各自率领一支门徒到全国各地创建宗门。
七子之一的广宁子郝大通，游历到华山之时，想起当年师傅王重阳在华山与群雄论剑，争夺《九阴真经》归属，追慕遗风，遂在此地传下道统，建立华山派。
而且郝大通本人大器晚成，在九旬高龄时期「紫霞神功」大成，纵横天下，名声之盛，一时无两。华山派在他的带领下日渐壮大，与少林、武当、峨嵋、崆峒和昆仑并称中原六大门派。
可惜花无百日红，一个门派亦是如此。
在郝大通死后，一连几任掌门皆是资质平庸之人，更是教出好几位不肖弟子败坏门风。
其中以鲜于通最甚，他为人奸诈狠毒，道德败坏，对救命恩人胡青羊始乱终弃，为夺掌门之位害死自己师兄白垣，最终被明教第三十四代教主张无忌揭发罪行，自食其果在金蚕蛊毒折磨下凄惨死去。
光明顶一役，华山名声扫地，受人指指点点，在途中遭到朝廷的伏击，无数为精英高手身葬万安寺，元气大伤。
明教教主张无忌从峨眉掌门周芷若手里取得屠龙刀和武穆遗书，将其交给光明左使杨逍，并立他为明教三十五代教主，随后携手爱人赵敏隐居冰火岛。
朱元璋野心勃勃，见张无忌隐居海外，设下毒计谋害杨逍，取得屠龙刀和武穆遗书，凭借二宝号令天下群雄，驱除鞑虏，建立大明江山。
岂料，夺得天下的朱元璋寡恩薄义，借助手里的兵权率先对老本家明教开刀，明教哪能架得住千军万马的强攻，被迫退守黑木崖，将明教的‘明’字拆成日月，自称‘日月神教’。
与此同时，朱元璋也忌惮中原武林的力量，对代表武林势力的六大门派进行血腥镇压，六大门派之名由此瓦解，峨嵋、崆峒、昆仑被迫封山，周芷若手里的《九阴真经》在战火中遗失，就此成为武林传说。只有老牌名门正派少林和武当顶住了压力，成为武林泰山北斗。
而后朱元璋去世，皇长孙朱允炆和皇四子朱棣为争天下打得不可开交，武林这些门派才有一丝喘息之机，渐渐发展起来。
