荷兰人入侵漳州的当天，崇祯皇帝也在北京接到了琼州的奏折，崇祯看后将奏折放到一边，然后又问王承恩：琼州锦衣卫没有奏报上来？王承恩笑道：可说呢，之前锦衣卫的奏报总要比地方上的奏报早来几日的，这琼州的可奇了，总督府的奏报递上来，锦衣卫的奏报也才刚到。崇祯冷笑道：怕是这里边有隐情，承恩啊，你说说，若锦衣卫不跟朕一条心了，该如何处置？王承恩便道：锦衣卫是大伴的奴才，若奴才跟主子不一条心了，那便是留着也没用了。
崇祯便轻轻拍了下桌子说：朕何尝不知道，锦衣卫里边乱七八糟，勾心斗角，朕不过是看在孝康敬皇后的面子上罢了，不过他们怎么斗，若是还存着一份忠心，朕也便忍了，若是阴以为私，朕绝不宽待。王承恩便小心的问：那大伴的意思是动一动琼州锦衣卫？崇祯想了想说：且先等等，既然他们说是海盗，那就让兵部下文，让吴宗达和郑芝龙全力剿灭也就是了。王承恩拿着折子正要出去，崇祯又道：去把赵士锦叫来。
不多会儿，赵士锦便到了暖阁，见过礼后，崇祯便说：崖州遭了海盗，损失惨重，想必你知道了吧？赵士锦便道：今日虽不该臣当值，但亦有所耳闻，只是内情不甚清楚。崇祯便笑道：今日又不休沐，你如何就不当值？赵士锦便道：陛下明鉴，考功司之职乃臣的份内，不分当值不当值，臣的意思是今日不该臣随侍陛下左右。崇祯点点头，便问：那崖州之事，你如何看？赵士锦便道：臣虽不知内情，但也知道，自开海以来，为着通商便利，陛下严令沿海各省与水师配合大力剿灭海盗，不几年便海晏河清，如何海盗突然敢炮轰崖州了？还请陛下明鉴。崇祯便道：是啊，朕也是这个意思，必要派人下去查一查，你觉得派谁去妥当？赵士锦便道：若非忠贞可信之人不能查明此事。崇祯便道：是啊，毕竟吴宗达是老臣了，又有从龙之功，便是有什么错，朕又如何忍心处置？
赵士锦心想：这是又想找人背锅呢，你爱惜自己的名声，别人就不爱惜了，既然你都说的这么露骨了，只怕我今天是躲不过去了。想到这里便说：若陛下相信，臣愿往琼州调查此事。崇祯笑道：爱卿说的什么话，朕岂能不信爱卿，爱卿可还有什么要求，尽管提出来。赵士锦便说：此事关系重大，还得请都察院和翰林院参与才是。崇祯便道：爱卿可有人选？赵士锦便道：大理寺推断冯家桢素以公正著称，可堪大用，此外，翰林院阁司修撰王夫之，少年英才，陛下亦多次褒扬，亦可一用。崇祯虽有些不想用，但是毕竟如今是求人办事，又把话说在头里了，不好反悔，便道：既然你觉得可用，那便令二人随你前往吧。
赵士锦走后，陆遥便问：怎么感觉你不太想用冯家桢和王夫之？朱由检便道：这两人都是阳明心学的门徒，赵士锦这是跟我讨价还价呢，他也不想想，若没有我的提拔，他一个京郊小民之子，能有今日？不思一心报效皇恩，专以他们心学为重，真是让我寒心。陆遥笑道：这就是高处不胜寒啊，再说了，你都让人家替你卖力了，还不许人家得点实惠？这也说不过去，况且如今心学的书院也开了，日后成为士林扛鼎也未可知，只怕你阻拦也是阻拦不住的，既然他们能办事、肯办事，如何不用起来？朱由检叹气道：先生说的是，我也知道，只是...罢了，罢了，那些都是后辈的事了，如今也顾不得了。
七月二十八日，崇祯下旨，任命考功司副总办赵士锦为钦差大臣、东南巡按，奉旨南巡琼州、两广、福建，专司开海、海防、剿匪等事，又命大理寺推断官冯家桢、翰林院阁司修撰王夫之为副使，一同前往。
却说三人带了侍从十多人，一路南去了，崇祯心里却还是有些不踏实，崇祯问王承恩：西厂还是不经事啊，这样的事情竟然都没有报上来。王承恩便道：皇上赎罪，是臣的过失，只是当年处置魏忠贤，东厂西厂都吓破了胆，很多要么逃逸，要么自裁，虽有些得力的隐了下来，毕竟是少数，后来随重建西厂，亦是在秘密之中，又不好大张旗鼓，所以如今只在京里各衙门、重臣布置停当了些，其他一些重要的府、港府、省会刚有涉猎，至于其他的州市，只怕一时半会还不得建立起来。崇祯便道：是啊，朕是有些难为你了，如今做到这一步也实属不易了，不过西厂的网线建立你要抓紧布局了，不要怕花钱，朕让你兼管着上林苑监司所为何意？不就是为着支取便利嘛。王承恩忙道：臣谨遵旨意。崇祯又道：朕若没有西厂，便如同瞎子一般了，朕就是要让西厂当成朕的眼睛，如今的情形你可都看见了吧，天下的人都算计着朕呢！王承恩忙跪下道：臣定当为陛下效犬马之劳，不令陛下劳心！
这边钦差大臣一路南下，八月十一日，崇祯正在中和殿批阅奏折，韩如愈面色凝重的进来，跪下道：陛下，福建总督府有紧急军报。崇祯忙命高起潜讲军报呈上来，韩如愈便道：熊文灿来报，称自七月七日以来，荷兰人伪为海盗，在东南沿海不断骚扰劫掠过往商船，更强占厦门湾，意图对漳州不轨，各因考虑陛下开海的国策，亦不愿与荷兰轻启战端，故只命地严加防备，特请陛下圣裁。崇祯看奏折后边还有锦衣卫福建镇抚使的联署，便面色铁青道：这些荷兰人是想做什么？他们有什么所图？韩如愈便道：荷兰人要求赔偿军费、不得与葡萄牙人和西班牙人通商，只能与荷兰人通商、进一步开放松江以北各港口给荷兰人...不等韩如愈说完，崇祯一拍桌子呵斥道：好大的胆子！小小的西夷鬼，也敢如此放肆，给熊文灿回复，让他不要畏首畏尾，务必全歼厦门港的西夷人，给他们点颜色看看！
韩如愈忙下去行文去了，陆遥便问：为何不让水师出战？朱由检道：不过小小荷兰人，还用得着水师？未免太看得起他们，再说了，先生不也说过，小不忍则乱大谋嘛，若动了水师，怕是要跟荷兰人全面开战了，怕是对开海不利。陆遥便笑道：也不是这么说的，若一味纵容下去，让他们在沿海不断骚扰来往商船，对开海也是不利，况且让葡萄牙人和西班牙人觉得咱们大明保护不了他们的商务利益，对开海也是不利的，再说了，荷兰人如今是日薄西山了，没了荷兰人，日后还会有其他商人来往贸易的。朱由检忙问：哦？先生的意思是荷兰人快不行了？陆遥说：是，马上的，英国人就要崛起了，荷兰人的海上霸主地位将要不保了，他们将要在全世界掀起瓜分世界的狂潮了，咱们也要提高警惕，不断发展科技，增强自身实力，对于海外一些战略要地也得经营一二了。朱由检有些紧张说：怎么？如今鞑子未平、西北动荡、朵甘和乌思藏还阴奉阳违，难道世界大局又要对咱们不利了？陆遥笑道：当然了，这些都是好几十年之后的事了，如今说了不过是未雨绸缪罢了。
正想着，外边有人来报说：启禀陛下，考功司少丞刘汉卿求见。崇祯便道：宣吧。内侍传了刘汉卿进来，刘汉卿进了殿来，倒头就哭拜在地道：皇上！皇上要替我们刘家做主啊！崇祯有些莫名其妙道：这是从哪里说起，赶快起来回话，有什么冤屈，但讲无妨，若真有冤枉，朕自当为你做主。
刘汉卿这才起身道：陛下，臣刚刚得到消息，荷兰人本月初水陆大军进犯漳州，我那可怜的侄儿，他还不到二十岁啊，就以身殉国了！皇上啊！崇祯听后大吃一惊，忙道：什么！漳州可有失？刘汉卿不由一愣道：这个，这个，臣实不知，许是没事吧...崇祯起身来回走了一趟，又问：你还知道什么？刘汉卿又是一愣道：臣还听说荷兰人上月二十六日就攻打过一次漳州，但是没有得逞，故而在次进犯，我那侄儿一心报效皇恩，冲锋在前，却被人在背后放了冷枪，他死不瞑目啊！崇祯便道：你怎么知道他是被人放的冷枪！刘汉卿有些支支吾吾的说：臣，臣也是听人说的，但是，但是皇上明察，他不过是个千户，冲锋自有戍卫军在，便是他如何在前，那些总兵、同知的都没事，怎的他就没了？若说不是有人暗中放冷枪，臣死都不信！我二弟只有这一个儿子，如今没了，让臣痛心不已啊...刘汉卿只管在这里哭哭啼啼，让崇祯不胜其烦，但南直隶刘家是南直隶的大世族，其家中子弟多在朝中任职，便只有好言宽慰说：爱卿放心，若果然如此，朕定绝不宽绕，必要为你们刘家讨回公道。好说歹说，才把刘汉卿劝走。
刘汉卿一走，崇祯便发了大怒道：熊文灿是干什么吃的？说什么不过沿海劫掠商船，说什么怕对开海的国策不利，人家这不都打到家门口了！他来回走了两步，然后高声喊道：给澎湖水师和南海水师下旨，让他们给我狠狠的打。他本想下旨重重的惩处熊文灿等人，但是又想到打仗还得暂时用着他们，便压下了怒火。
韩如愈正要下去，忽然旁边一人喊道：且慢，陛下，臣有本上奏！
