几天后，崇祯召集内阁、军机处众臣在乾清宫议事，崇祯首先说，因琐事许多，为了提高效率，以后可每月末在乾清宫集中议事，开始吧。
众人行礼后，杨嗣昌站出来，摸出一个折子，展开后说，下边议第一事，朝鲜事。然后把情况简要说明了一下，这是一件好事，基本没有什么意见，崇祯便说，拟旨，令朝鲜国太子及大臣来京递交国书。
杨嗣昌又道，第二事，修筑自京师至南京驰道，照京师至山海关驰道办理。分为京师至天津、天津至保定、保定至德州、德州至济南、济南至中都（凤阳）、中都至南京（应天）几段，目前先修筑京师至天津段，工期为4个月，初步造价约96万两，皇家钱庄出资46万两，其余50万两分为5000股，每股100两，向天下募股，按股比分红。请议。
薛国观立刻道，如此好事，臣愿意购买一千股！钱士升白了他一眼说，我可没有薛大人有如此家资，花不起这些钱。崇祯道，没钱就没钱，今天只议事，不必互相攻讦，薛爱卿有此心甚好，朕记下了。薛国观忙高兴的说，臣只知报效陛下，自然不会在意钱大人说的。
崇祯问，目前内阁还缺一人，薛爱卿可有合适的人选？薛国观忙道，臣以为杨景辰可堪此任。崇祯道，说起来，杨先生还曾教过朕，既然如此，擢杨景辰兵部侍郎、建极殿大学士入阁吧。
钱士升还要在说什么，成基命悄悄拉了一下他的衣袖，他才摇摇头不在说话，崇祯见无人反对便说，既然此事无人反对，便拟旨吧，钱到位了，即刻开工。
杨嗣昌又道，第三事，建农业局事。拟在格物处下设农业局，将农司发现的新农作物，研发的新型农具和农业技术加以推广，并取消农民人头税、免交公粮、免除徭役事。
程国祥道，如此一来，朝廷赋税岂不是要减少？薛国观忙说，怎么会？去岁朝廷赋税入库1975.3万两，但是人头税仅占4成，其余皆是商税、矿税所得，臣以为，影响不大。
杨嗣昌也说，正是如此，仅徐家上缴红利就超过千万，陛下也曾说过，商业之利何其大也！臣以为应当继续鼓励实业，增征矿税、商税，以弥补差额。
成基命道，人头税乃是历朝历代有之，如何能轻易取消？杨嗣昌反驳说，所谓民为邦本，本固邦宁，现流民泛滥，皆因豪强强占土地，巧取豪夺，虽陛下圣明，着上林苑监安排流民至皇庄耕种，更有以工代赈之法，然而，更要从根源治理，使耕者有其田，臣以为不但要免赋税、免徭役，更要重新丈量土地，分配给流民，使之安居乐业，才好国富民强也。
徐光启也道，臣尝从田中来，颇以为杨大人所说为然也，天下疲敝，皆因农本不固也。
崇祯便说，既然如此，那便拟旨，设农业局，加宋应星为总办，取消人头税、粮食朝廷折价购买、免除徭役，至于推广研究之事，着农业局办理。
成基命此时跪下道，陛下，老臣年迈，不堪使用，请陛下准臣告老。崇祯笑道，成爱卿何出此言，朕不准，且继续议来。
成基命只得站起身，杨嗣昌接着说，第四事，开恩科事。现京师大学堂、皇家军官学堂、天津水师学堂已经筹备完毕，国子监按之前恩科考录生员；京师大学堂拟招募生员500人；皇家军官学堂拟招募生员500人，并着现役千户以上军官遴选100人入学；天津水师学堂拟招募生员200人，并着在天津修建天津造船厂，兴建战船。格物科、军科、文科各主副考官以前诏任。
开恩科这样的好事，自然不会有人反对，崇祯又说，各科已有主副考官，自然还要有个总考官，统筹这三科，成爱卿，此重任你可担的？成基命忙跪下道，老臣敢不效命，老臣感激陛下！万岁万岁万万岁！敢问陛下，何时开恩科？
崇祯道，着钦天监择吉日，近日即开恩科。杨嗣昌又道，第五事，军制。拟将军队分为戍卫部队和野战部队，戍卫部队防区分为北直隶戍卫区、九镇戍卫区、济南戍卫区、南直隶戍卫区、成都戍卫区、昆明戍卫区、南昌戍卫区、闽广戍卫区；野战部队共分十一军，天策军驻区顺天府（京师）、九镇军驻区太原、济南军驻区济南、平夷军驻区西安、天恩军驻区应天府（南京）、安蛮军驻区成都、伏波军驻区昆明、天威军驻区贵阳、南昌军驻区南昌、逐寇军驻区福州、平北军驻区平壤。辽东事从权益，暂不列入军制改革之列。
停了停后，杨嗣昌继续说，编制亦要改革，拟9人为一什，设什长一人、9什为一百户，设百户一人，参将一人、9百户为一千户，设千户一人，参将两人，监军一人、9千户为一师，设同知一人，参将三人，监军一人、3师为一镇，设镇门一人，参将四人，裨将二人，监军两人、3镇为一军，设总兵一人，参将六人，裨将四人，监军三人。每镇共计59086人，由兵部统一招募练兵分配兵士，自镇门下军官自皇家军官学堂中选任，自镇门上军官自皇家军官学堂中选任，镇门、总兵由兵部选任，粮饷按额定数由兵部、户部发放，有缺员者，当逐级上报总兵，统一报兵部补选补任。
杨嗣昌接着说道，取消五军都督府，于军机处下设粮饷司，用以粮饷准备，运送粮草等事；军备更新事由格物处兵司负责。
徐光启听完后，张大嘴合不拢，半响才道，如此一来，则虚报军饷事绝也，则朝廷负担大大减轻也！倘若果能成行，实乃我大明万幸也！
崇祯笑着说，徐爱卿可放心，朕当全力完成此事，众爱卿亦当全力辅助朕。众人齐声道，臣定辅助陛下，完成以旷世大业也！
