看着眼前培养罐里和自己一模一样的少女，少女总觉得很可怜她们，但是由于理事会的逼迫，她们如果不在暗部「海雾」的基地里诞生，就会在其他暗部的基地诞生。也不知道其他暗部成员会怎样对待她们。所以，拥有成熟克隆技术（从白色彗星和海军法典那里得到的）的「海雾」就不得不理顺成章地接下这个任务。
用学院都市的技术克隆，她们只有几年的寿命和Level 2～Level 3的能力等级。但是用「海雾」的技术克隆，不仅有远超正常人的寿命，还有Level 5的等级以及灵魂网络交流（除了由电波组成的御坂网络），这还不算植入无意识海雾核心进行强化的结果。但为了让两万名御坂妹妹顺利诞生，而不是只诞生128名满足需要，不得不把单体能力看起来像是降到Level 2、把剩下的演算力全部封锁了。
使用量产海雾核心，以保证她们不会死亡。有必要时，少女可以以超战舰的权限通过海雾核心临时接管她们的身体。
不过，一切都在自己的掌握里，少女扬起了一个微笑：“放心吧，我不会让你们遭受痛苦的。”
“姐姐大人，南极基地发来消息，加贺已经率领一支舰队前来这个世界了。”111号舰走过来，对少女说道，“另外她们还带了新研发的多演算核心型超级计算机，应该可以为姐姐大人您的心智模型恢复做辅助。”
“太好了，我终于可以恢复自己的心智模型了！”少女高兴地说道。虽然从脸上看不出来高兴就是了（面瘫）。
“但也有个坏消息，”111号舰说道，“主世界出现不明舰队，其科技类型和我们相似，但水平远远不及我们，现在正在袭击人类舰队。赤城希望姐姐大人您能先回去一趟。”
“这样啊……那明天开学……通知赤城，我明天再回去。”少女说道。
“了解。”
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这一天，常盘台中学开学了，但似乎并没有天朝开学时的气氛——那种类似于一部美国电影《2012》的气氛。
“同学们安静一下，这学期我们有新同学，”那名老师进来后说道，随后把头扭向门外，“御坂同学，进来吧。”
“有新同学啊？嗯……等等？御……御坂？（御坂的日语发音是“misaka”）。”坐在教室最左边后面靠窗位置的御坂美琴嘟囔了一下，突然发现了什么。
她又想起昨天看到的“自己”，突然有种不祥的预感……
“御坂同学？难道是御坂学姐的妹妹之类的？”
“可能是吧？对了，之前我听说过都市传说，说的是御坂学姐的军用克隆人，难道她是……”
“别想那么多，学园都市不可能那么不人道主义的！”
“……”
“……”
然而，走进来的少女让许多人都惊呆了：茶色的齐肩短发，茶色的瞳孔，不用化妆就已经很俏丽的面孔。再往下看，纤细的身材，白皙的皮肤……这不是御坂美琴是谁？
但已经有一个御坂美琴坐在教室里了……那么，这是谁呢？
御坂美琴看着“御坂美琴”在黑板上写下了两个字和一串数字：御坂0109号。
“咦？御坂？编号？不会是御坂学姐的军用克隆人吧？”
“难道那个都市传说是真的？”
“学园都市难道真的做出了这样不人道主义的事？”
“……”
“……”
少女没有在意下面议论纷纷的大小姐们，心智模型想要无视其他人的评论、自己干自己的事也不难，无论如何接近人类，心智模型终究是AI的一种，想要接近人类很难，但是想要做出AI的反应却很容易。
“今后的这个学期，我就要和大家一起学习和生活了，希望大家多多指教。”
讲台下愣了一两秒，突然掀起一阵响亮的鼓掌声。新同学嘛，欢迎还是要的。
“嗯，那么……御坂同学你就坐御坂美琴同学身边吧，”看起来时班主任的老师扫视了下面一眼，发现只有御坂美琴身边??空位。
“嗯。”少女看起来很平静，心里却是一副惊涛骇浪的样子。
［纳尼？和bilibili坐同桌？太好了！］
（貌似原作里不是同桌模式，而是单人单桌的样子，但为了支线剧情发展，那就设定为同桌模式吧）
“真是的……怎么又是你啊……”御坂美琴捂着额头对少女说道。
“姐姐大人，昨天我貌似告诉你了呢，我是新入学的学生。”少女面无表情地说道，同时她也拿出书本??，放在桌面上准备听课。
“你们看，御坂学姐和御坂同学好像认识呢！”远处两个女生悄悄地说道。但是在御坂的全方位感知的扫描下，声波信息被无损地传到御坂的核心里，然后传到大脑。但她并不在意。
“所以，”御坂美琴突然拍了一下御坂的肩膀，“既然有着和我一样的样子，希望你不要用我的样子给我添麻烦。”
“当然不会。”少女可不是那种脱节的穿越者，自然有底线。
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此时，大和号及其所属雾之舰队——
还不容易搞定了佐达大帝他们，结果他们所有人都自杀了，根本不能从他们口中套出更多信息。
但至少获得了白色彗星，这可是水瓶座文明留下的最高科技成果之一，成熟的生物科技及其附属的灵魂科技、高超的制造战舰的技术，军工科技方面有超长距空间跃迁技术（最长跃迁距离超过一百万光年，比如白色彗星本体，但能源消耗极大，几乎需要特蕾莎特行星的补给才能做到几次）、Calakulm级战列舰制造技术、以及没有被加托兰蒂斯使用过的成熟空间切割科技和使用中的空间封锁科技（对次元空间来说不算，这里的次元空间设定是有高维空间效果的一个作弊手段），甚至处于实验室阶段的『零光速绝对刚体防御』，很多技术都是大和都为止惊叹的??
很快，和地球联合舰队交流了大概一周后，雾之舰队用白色彗星全部科技和部分自己的科技（包括破解海军法典的和对波动技术的深层次理解）来换取了白色彗星的使用权。
地球方面也很满意，虽然不能仔细研究白色彗星，但是也能获得这么多科技，足够自己消化很长时间了，有望快速提升自己的战斗力。
因此，大和现在正在返航的阶段，接受到了南极基地的讯息：主世界地球出现不明舰队，科技成分、性质和雾之舰队相似，但水平却远远不及雾之舰队的科技水平。目前无法对人类的电磁战舰造成伤害。
大概需要一年才能返航，大和也不敢把白色彗星动力全开，就把加托兰蒂斯在里面留下了什么自毁程序，动力一全来就被触发，但自己没发现。
虽然白色彗星不能进入超过一千倍光速的曲率航行，但单艘战舰还是可以的。现在，四艘金刚级战列舰嵌入了自己的宇宙战舰舰体，被五十艘拥有一千倍光速曲率航行能力的高配版仙女座级拥护着回到地球。
这些战舰，都有能防止空间攻击的改造版波动防御壁，以及带有空间武器科技改造的波动炮。
