在大明监国林毅的运筹部署下，打掉了郑芝龙所有的倚仗，葡萄牙殖民者，荷兰红毛子，东洋洋人等域外势力支持郑芝龙，全都成了画饼。
刘国轩被俘，仙霞关失守，明军80万重兵压境，亲生儿子和亲兄弟实行兵谏，这一切令郑芝龙幻想破灭，因为气火攻心身体也吃不消，心理防线彻底崩溃，因此郑芝龙无条件接受朝招安。
其实对于对于郑芝龙来说，接受朝廷招安已经不是第一次了，他的第一次是接受崇祯皇上的招安，那一次郑芝龙由一名大海盗兼大海商、军火商大佬等复杂的多重身份，摇身一变成为大明朝廷的要员，南安伯福建总镇，成了冠冕堂皇的名副其实的福建王。
这一次是接受了大明监国林毅为首的朝廷招安。因此有了第一次，郑芝龙对于朝廷招安也算是轻车熟路了。
不过这一次与上一次明显不同，在崇祯时代，朝廷对他的招安，明显是安抚的意思，因为朝廷鞭长莫及，没有力量把他剿灭，当时他的势力太庞大了，庞大到他的私人海军能把海上霸王荷兰红毛子的舰队干翻，庞大到朝廷无策无力。
朝廷无奈之余只有像对待李自成，张献忠这些流贼一样，采取安抚的政策，授予官职给其好处，让他们仍然拥护大明，不要生事，这不过是权宜之计。
可是眼前这次截然不同，这一次郑芝龙接受朝廷的招安，明显带有被迫的成分。明军大兵压境，剪除其羽翼，郑芝龙只剩下孤城一座，内部策反，众叛亲离，如果郑芝龙再不识时务，绝对是被剿灭的下场，没有任何悬念，也不会有第二种可能。
还好郑志龙还不算是一根筋，林毅对他的运筹也不是对牛弹琴，可谓是恰如其分。
因为林毅知道，从理论上说，郑芝龙能够接受崇祯皇上的招安，就能够接受他这位大明监国的招安；历史上郑芝龙能够投降大清，应该也能够投降大明。
事实证明，林毅是完全正确的。郑芝龙走投无路，不想灭亡只有乖乖俯首称臣。
尽管林毅也知道历史上郑芝龙的人品不怎么样，但是当他带着所谓的文武众臣跪在城门面前，把龙冠龙袍玉玺等高高举过头顶，跪迎接林毅的时候，林毅还是非常高兴的。
因为能让郑芝龙乖乖的接受招安，这毕竟是意义重大的事情。
这算是给了郑成功几分薄面，也算是准许他戴罪立功了，郑成功日后必将感激不尽，更加忠于大明，忠于他这位大明临国。
更重要的是一点，和平解决了福州的战事，解除了当地老百姓免受战乱之苦，功德无量。此时郑芝龙连他的御林军算上，福州城内还有数万人马。如果他负隅顽抗，誓死不降，坚守城池与明军血拼，顽抗到底，80万大军一起攻破城池不是难事，但是伤亡的军民百姓，难以计数，损失也难以估量。
和平解决这一战事，无疑造福了这些黎民百姓军民人等，使他们的生命财产免遭涂炭。
运筹成功这样一件大事，当然值得高兴。
此时福州城城门大开，守城的南军兵将，全都扔了刀枪打出白旗，然后原地集合待命。
郑芝龙和手下的文武百官脱了官服，把官印都拿了出来，在东门外跪迎大明监国林毅。此时官道上全都是明军了，简直如兵山将海，刀枪如林，盔明甲亮，兵甲森森。
大将军施琅全副武装，坐在马上，指挥万马千军严阵以待。卫队营的张华和锦衣卫头子马銮早就布置好了警戒，他们紧随林毅身边左右。
到了城门附近，林毅下了马。小颖、哲哲、苏茉尔等人紧随其后。
林毅看了看在场的数万名明军将士和南军的文武百官，从郑芝龙手上接过龙袍，龙冠和玉玺，当场宣布：“郑芝龙屯居福建，祸乱九省，罪在不赦。但是本监国有好生之德，念在其子郑成功、其弟郑鸿逵，能够悬崖勒马，为朝廷立下不朽之功勋，郑芝龙亦愿意悔过自新，愿意献城投降，继续效忠大明。特赦免郑芝龙一帮人等无罪，所犯罪行，一律既往不咎，因其献城有功，破格加封其为南王，加封郑成功为南安少王，加封郑鸿逵为金门总兵……”
郑芝龙这些人还真没想到，这位监国大人真的是言出必行，一言九鼎。当着这么多人的面宣布赦免他们无罪，还加封他的官职，皇恩如此浩荡，令郑芝龙、郑成功郑鸿逵和郑芝莞这些人不住的往上磕头，有的磕响头，一边磕头一边大喊：“多谢监国大人，皇恩浩荡，龙目有恩，我等必誓死报效朝廷，永不相判，日月可鉴……”声震宵汉。
林毅进城之后，郑芝龙早就把他的皇宫给林毅腾出来了。林毅搬到里面办公。
接下来，林毅交给郑芝龙一项特殊的任务。
这时有人把刘国轩从福宁监狱押过来了。郑芝龙，郑成功，郑鸿逵拦住囚车见到了刘国轩，刘国轩愕然……
未几刘国轩光着膀子，跪倒在林毅面前负荆请罪。
林毅哈哈大笑把他拉了起来，“本临国也赦免你无罪，破格加封你为福州总兵之职。愿你能够摒弃前嫌，再立新功。”
刘国轩几乎不敢相信自己的耳朵，然后感激涕零，跪倒在地，磕头不止，半句话也说不出来了……
数日之后，郑芝龙带着他的老婆孩子，一家人等到南安府上任，做起了名副其实的南安王。他日本的妻子田川氏，得报后带着郑芝龙的母亲丫鬟婆子等等一大家子高高兴兴地到南安府外迎接。
郑成功带着田川真纪子，和郑鸿逵，郑芝莞等人也来送行，一家人团聚了。
只是经过这一次突变，郑芝龙的身体染上了难以治愈的疾病，此后大部分时间都在南安养病，一直到数年之后寿终正寝。
郑成功，郑鸿逵等人送走了郑芝龙之后，返回福州继续勤王王。
现在福州当然也不称福京了，林毅仍然把她改成福州。
只是郑芝龙修建的这座皇宫规模及豪华虽然比不上北京、南京，但跟李自成和张献忠的西京还有一比的，住在这里也觉得舒适和新鲜。
接下来开始出榜安民，将郑家在福州的财产充公清算，连南军的其他战利品，统一入库，然后再分配。
城内城外的数万南军，也都接受了改编，根据自愿原则，愿意当兵的，继续留下吃粮当兵，那些被抢抓过来的不愿意当兵的就地遣散，让他们回乡。留下的愿意这些当兵的南军兵将，然后进行再挑选，合格者统一发给大明的军装和刀枪，从今以后他们就是大明朝的正式军人了，粮饷按规定照发。
那些不合格的兵将就地遣散，劝其回乡。
郑芝龙手下的那些所谓的文武百官，虽然没有治他们的罪，当然也不可能让他们全都官复原职了，这些人登记造册，先在原衙门待命，等大明京师内阁那边委派官员走马上任后，统一整顿吏治，再决定其任免去留。
这些南军将士和官员真是没想到如此便宜，不管是被遣散的，还是留下来接受改编成明军的，都觉得捡了天大的便宜，要知道造反是抄家灭门之罪，砍脑袋坐大牢是最轻的。现在全都既往不咎了，无论是继续留下吃粮当兵还是遣散还乡，这简直就是天大的便宜！
因此数万南军将士，包括文武百官在内，无不感念这位大明临国龙恩浩荡。
福建周围80万明军，加上收编的南军将士，在这一带勤王的将近百万大军。
至此，郑芝龙建立的大南帝国彻底消亡了。消息传到了大明的京师北京和陪都南京，轰动朝却。
北京内阁六部的官员，无不整冠抖袍望福建方向顶礼膜拜，包括太子朱糍良等人在内。
郑芝龙投降了，南疆也平定了，数年之前还是内忧外患，千疮百孔，濒临灭亡的大明朝，现在又成了一个生机勃发、朝廷统一行使主权的天朝大国。疆域之辽阔、万民之颂扬完全可以与太祖和成祖时期相提并论。
沉舟侧畔千帆过，病树前头万木春！
短短的几年如此丰功伟绩，谁人能与之比肩？恐怕太祖在世、成祖重生也会自叹弗如的。
京师的内阁高宏图等人暗中已经开始策划，为监国大人林毅张罗登坐殿之事了。他们认为，监国班师凯旋之后，此事必然提上日程，早作运筹，早做打算为上……
郑芝龙之事完了，但是林毅知道，郑芝龙虽然投降了，战争并没有结束。
接下来他开始厉兵秣马，运筹驱逐台湾红毛子收复宝岛的战事。这些红毛子这些年赖在台湾不走，奴役当地的人民，坏事做绝，丧尽天良，扶殖朝廷反动势力对抗大明朝廷，所犯罪行罄竹难书，是该跟他们清算一下的时候了。
