话说苏定方带领五十万大唐军队到达了百济的都城泗沘城。
扶余泰见苏定方带领五十万大唐军队和薛仁贵等人的五路大唐军队汇合，慌忙召集城中大臣与将领们在百济大殿中商议抵抗大唐军队的策略。
百济大臣朴文志对扶余泰说：“国王，可派城中所有的将士全部冲出城去与唐军决一死战。”
扶余泰同意了朴文志的策略。
接着，扶余泰下令：“城中所有的将士全部冲出城去，将士们务必要竭尽全力与唐军决一死战，务必要打退唐军，否则百济国将不复存在！”
城中所有的将士全部冲出了泗沘城，苏定方率领大唐的将士们迎战。
大唐军队兵多将广，而泗沘城中的将士只有五千，苏定方在此战中斩杀百济大将十员、士兵五百个，薛仁贵在此战中斩杀百济大将十员、士兵七百个，刘伯英在此战中斩杀百济大将六员、士兵五百个，刘仁轨在此战中斩杀百济大将五员、士兵三百个，刘仁愿在此战中斩杀百济大将四员、士兵两百个，吴黑闼在此战中斩杀百济大将三员、士兵一百个，契苾何力在此战中斩杀百济大将两员、士兵五十个，程名振在此战中斩杀百济大将一员、士兵两百个，大唐的将领在此战中没有一个伤亡的，百济的大将全部战死，大唐的士兵和百济的士兵则各有伤亡，百济的士兵由于人数少，两个时辰后便全部战死。
泗沘城的将士全部战死在了城外，扶余泰见城中已无将士，便想亲自出城与大唐军队决一死战，百济的大臣朴文志说：“国王，您不能出城与大唐军队决一死战，如果您遇到什么不测的话，那百济国就完了！”
扶余泰说：“现在城中只有大殿上的文臣和城中的百姓了，除了我，还有谁能出城与大唐军队决一死战呢？”
朴文志说：“国王，微臣愿出城与大唐军队决一死战，微臣年轻的时候从过军，也曾上阵杀过敌，国王，您就让微臣出城与大唐军队决一死战吧！”
扶余泰说：“朴大人，您如今已经年过七旬了，您怎么能出城与大唐军队决一死战呢！”
朴文志说：“微臣虽然已经年过七旬，但依然能够舞刀弄枪，微臣今年七十二岁，如果微臣今天战死在泗沘城外，请国王记住微臣战死时的岁数！”
扶余泰说：“朴大人，您不能出城！千万不要出城啊！”
朴文志说：“国王保重！”
朴文志说完便转身走出百济大殿，取了一把大砍刀，骑上一匹战马，出城与大唐军队决战，朴文志出城后，扶余泰也来到了城下。
扶余泰手捧一副黄金铠甲，对朴文志说：“朴大人，这副黄金铠甲我珍藏了十五年，从未穿过，因为我舍不得穿，这副黄金铠甲是倭国大将武藤村英送给我父亲的，我父亲又把这副黄金铠甲送给了我，我今日把这副黄金铠甲送给您，您一定要保护好自己啊！”
扶余泰说完便痛哭了起来，朴文志也流下了眼泪。
扶余泰擦干眼泪，下了战马，穿上了扶余泰送给他的黄金铠甲，然后骑上战马，手舞大砍刀冲向了大唐军队，薛仁贵迎战，一戟刺死了朴文志。
扶余泰哭着回到了城中。
扶余义慈的长孙扶余文思对扶余泰说：“国王和太子虽然都出了城，但依然活着；叔父统领兵马，就擅自称王，如果大唐军队撤退，叔父和我的性命就无法保全了。”
扶余文思说完便走出百济大殿，扶余文思让两个侍从编织了一个结实的大竹筐，然后又让一个侍从找来了一条结实的长麻绳，最后，扶余文思让三个侍从把长麻绳系在大竹筐上，扶余文思坐在大竹筐中，三个侍从用大竹筐在城楼上把扶余文思送到了城下。
扶余文思到了城下后便来到苏定方面前，扶余文思对苏定方说：“苏元帅，我愿投降大唐。”
扶余文思投降大唐后，城中的大臣纷纷出城投降了大唐，苏定方手持大唐旗帜进入泗沘城，登上城楼，然后苏定方将大唐旗帜插在了泗沘城上，城中的百姓以为泗沘城已经被大唐军队占领，纷纷出城迎接大唐军队，苏定方在城上对城下大唐的将士们喊到：“大唐的将士们，进城吧！从现在起，整个百济都属于我们大唐了！”
大唐的将士们非常高兴，进入了泗沘城中。
大唐的将士们进入泗沘城后，百济大将弥植带着扶余义慈进城投降大唐，扶余隆也前来投降大唐，扶余泰见大势已去，只好也投降了大唐。
苏定方将占领百济的消息通过书信派一个士兵传给了唐高宗，唐高宗得知百济被大唐占领后，欣喜异常，唐高宗对送信的士兵说：“你返回泗沘城传朕口谕，命左骁卫将军刘仁愿与新罗王子金仁泰共同守卫泗沘城，并管理百济，刘仁轨辅助刘仁愿和金仁泰共同守卫泗沘城并管理百济。”
送信的士兵返回泗沘城把唐高宗的口谕传给了刘仁愿、刘仁轨，刘仁愿、刘仁轨接了唐高宗的口谕，然后刘仁愿给新罗王子金仁泰写了一封信，通知金仁泰来泗沘城和自己共同守卫泗沘城，并共同管理百济，刘仁愿让送信的士兵把信送到新罗王子的王子府，新罗王子金仁泰接到信后便带了七千个新罗士兵去了泗沘城。
金仁泰和七千个新罗士兵到达泗沘城后，苏定方留下一万个大唐士兵驻扎在泗沘城，并叮嘱刘仁愿、刘仁轨：“二位将军一定要好好管理百济，万万不能让百济脱离大唐！”刘仁愿、刘仁轨齐声说：“请苏元帅放心！末将一定不辱使命！”
苏定方叮嘱完刘仁愿、刘仁轨后，便带着扶余义慈、扶余隆、扶余泰、扶余文思以及大唐的将士们离开了泗沘城，准备去向唐高宗复命。
苏定方等人到达长安后，许敬宗告诉苏定方：“皇上和皇后去洛阳了，皇上去洛阳前让我在你回到长安时转告你，说苏元帅回到长安后带着扶余义慈、扶余隆、扶余泰、扶余文思到东都洛阳去，其他人全部留在长安。”
苏定方说：“好，我知道了。”
接着，苏定方带着扶余义慈等人去了洛阳，苏定方到达洛阳的时候，唐高宗带着武媚娘和文武百官在则天门前迎接苏定方。
苏定方带着扶余义慈等人到达则天门，唐高宗重赏了苏定方，留扶余义慈、扶余隆、扶余泰、扶余文思在洛阳做官。
第二天，唐高宗令大唐的所有官员、将领到民间和百姓们一起庆祝大唐占领百济，庆祝时间为三天。
公元661年六月，新罗国王金春秋去世，享年五十九岁，其子金仁泰从泗沘城赶回新罗国都金城继承新罗国王之位。
公元661年十二月，驻守回纥的药葛罗·婆闰去世，回纥首领比粟反叛大唐。
唐高宗得知比粟反叛大唐后，命右屯卫大将军郑仁泰为主将，薛仁贵为副将，带领十万大军征讨回纥。
郑仁泰、薛仁贵以及十万大军出发前，唐高宗在内殿赐宴，郑仁泰和薛仁贵赴宴。
在宴席上，唐高宗对薛仁贵说：“薛将军，朕听说古代能射箭的人可以射穿七层铠甲，你射五层铠甲给朕看看。”
薛仁贵应命，取来弓箭，又找来五层铠甲，让郑仁泰用长棍高挑那五层铠甲，接着，薛仁贵张弓搭箭，一箭射向那五层铠甲，那五层铠甲瞬间被薛仁贵一箭射穿，唐高宗大吃一惊，命内侍取了一副坚甲赏赐给了薛仁贵。
第二天，郑仁泰、薛仁贵率领十万大军征讨回纥。
郑仁泰、薛仁贵以及十万大军行进到被回纥控制的天山的时候，遇到了回纥大军的阻挡，薛仁贵连发三箭，回纥大军的三员主将突鲁言忠、突鲁言义、突鲁言文皆中箭而死。
回纥大军见三员主将皆中箭而死，便全部向大唐投降，薛仁贵下令将向大唐投降的六万回纥士兵全部坑杀。
郑仁泰、薛仁贵以及十万大军过了天山，直取回纥最重要的城池铁勒城，比粟的府邸就在铁勒城中，铁勒城的主将是突鲁三兄弟的堂弟突鲁言勇。
郑仁泰、薛仁贵到达铁勒城后，突鲁言勇出城迎战，突鲁言勇说：“你们大唐军队是怎么通过天山的？天山的三员主将是我的三位堂兄，我的三位堂兄都是回纥的名将，竟然没能阻挡住你们大唐军队！”
薛仁贵说：“你的三位堂兄被我连发三箭射死了，他们带领的回纥大军全部向我大唐军队投降，但我把那些向我大唐军队投降的回纥士兵全部坑杀了，本将军今天就让你去陪你的三位堂兄！”
薛仁贵说完便一戟刺向突鲁言勇，突鲁言勇还没有反应过来就被薛仁贵一戟刺死了。
铁勒城中的大臣、将士、百姓全部出城向大唐投降，郑仁泰不接受他们的投降，便把他们的妻女全部俘获，赏赐给大唐将士，铁勒城中的大臣、将士、百姓无奈，只得离开了铁勒城，此时，铁勒城中只剩下比粟和回纥的三个副首领忽尔惕、忽尔获、忽尔青，比粟见铁勒城中的大臣、将士、百姓的妻女全部被郑仁泰俘获，铁勒城中的大臣、将士、百姓全部离开了铁勒城，便拔剑自刎于府邸中，忽尔惕、忽尔获、忽尔青跑出了铁勒城，薛仁贵将忽尔惕、忽尔获、忽尔青活捉。
薛仁贵以一人之力平定了回纥叛乱，郑仁泰对薛仁贵说：“薛将军，这次你立下大功了，平定回纥的功劳全是你一个人的，我留下三万大军驻守铁勒城，你带着七万大军回东都洛阳接受皇上的赏赐吧。”
薛仁贵说：“郑将军保重，仁贵带七万大军回东都洛阳复命去了，至于皇上的赏赐，仁贵会为郑将军留一份的。”
郑仁泰说：“那就多谢薛将军了，薛将军路上小心。”
薛仁贵说：“谢郑将军关心。”
薛仁贵说完便带着七万军队往东都洛阳的方向进发了。
薛仁贵带着七万军队到达东都洛阳后，唐高宗重赏了薛仁贵，薛仁贵从唐高宗重赏给他的赏赐品中取出了一小部分，派人送往铁勒城。
郑仁泰收到薛仁贵分给他的那一小部分赏赐后非常高兴，写了一封感谢薛仁贵的信让为他送赏赐品的人给薛仁贵带了过去。
薛仁贵收到郑仁泰感谢他的信后给郑仁泰回了一封信，让忽尔惕给郑仁泰送了过去，薛仁贵接着又让忽尔获、忽尔青去铁勒城和郑仁泰以及留在铁勒城的三万大军共同驻守铁勒城，并让忽尔获转告忽尔惕，让忽尔惕也留在铁勒城驻守。
公元662年，西突厥反叛大唐，被唐高宗贬到西突厥边境的来济不穿甲胄，挥剑冲入西突厥的叛军队伍中，来济手下的将领李昭析拿着来济的甲胄冲入西突厥叛军的队伍中给来济送甲胄，来济对李昭析说：“我多年前就该被处死了，蒙皇上赦我性命，当以身报国！”
来济说完挥剑杀死了西突厥叛军首领之一葛禄花剌，来济由于不穿甲胄，在与西突厥叛军对战的时候身中数刀，最终流血而死，死时五十三岁，李昭析也被西突厥叛军所杀。
唐高宗得知来济因应对西突厥叛乱而战死的消息后，赠来济楚州刺史，赐来济的灵柩还乡。
在来济战死的这一年，任雅相在西突厥病逝；庞孝泰被唐高宗派往高句丽的国都平壤作战，最终因为援军和补给没能及时到达，庞孝泰最终战死在平壤附近，死时六十二岁，庞孝泰的十三个儿子也全部战死在平壤附近；程名振在自己的府中病逝，享年六十六岁。
公元663年，倭国大将武藤华章扶植在倭国做质子的百济王子扶余丰为百济国王，并派陪同扶余丰在倭国生活的百济大将鬼室福信、百济僧侣道琛与十万倭国士兵去收复被大唐占领的百济。
扶余丰等人到达百济的白江口后，鬼室福信指挥数千艘大战船围住白江口，驻守在白江口的唐军将领刘仁洪派人将鬼室福信指挥数千艘大战船围住白江口的消息告知了刘仁愿、刘仁轨，刘仁轨对刘仁愿说：“仁愿，你驻守在泗沘城，我带三万士兵到白江口阻挡鬼室福信指挥的数千艘大战船。”
刘仁轨让三万士兵在白江口附近打造了数百艘巨型战船，然后指挥数百艘巨型战船在白江口阻挡鬼室福信指挥的数千艘大战船。
正在这时，倭国大将武藤华章带着数百艘巨型战船来到白江口支援鬼室福信。
大唐军队与倭国军队在白江口大战了一天一夜，倭军大败，逃到对马岛驻军。
第二天中午，鬼室福信无缘无故的将道琛杀死，扶余丰因鬼室福信无缘无故的将道琛杀死，而且在军中的威望过高，不把自己看在眼里而下令将鬼室福信诛杀。
第三天，武藤华章带领数千艘大战船和数百艘巨型战船来到白江口，刘仁轨再次指挥大唐的数百艘巨型战船与倭国的数千艘大战船和数百艘巨型战船在白江口大战。
刘仁轨下令点燃大唐军队中五十艘巨型战船，然后让水性好的大唐士兵划着五十艘被点燃的巨型战船直冲倭国军队的数百艘巨型战船，当大唐军队中的五十艘巨型战船撞上倭国军队的数百艘巨型战船后，划着五十艘被点燃的巨型战船冲向倭国军队的数百艘巨型战船的那些水性好的大唐士兵集体跳进水中，倭国军队的数百艘巨型战船全部被烧毁。
武藤华章身受重伤，跳水逃生，倭国军队在白江口第二次被大唐军队打败。
半月后，武藤华章带着数千艘大战船再次来到白江口，结果又被刘仁轨以火攻打败，倭国军队的数千艘大战船绝大部分被烧毁。
倭国军队在白江口第三次被大唐军队打败。
又过了半月，武藤华章带着剩下的数百艘大战船又一次来到白江口，刘仁轨又一次使用火攻，倭国军队剩下的大战船全部被烧毁，武藤华章跳进水中，刘仁轨取来弓箭，一箭射向武藤华章的后心，武藤华章中箭而死。
至此，倭国大军第四次被大唐军队在白江口打败。
扶余丰见收复百济无望，便从对马岛逃到了高句丽。
刘仁轨指挥大唐军队在白江口四次打败倭国的消息传到倭国后，倭国权臣井上英田遣使者稻田明哲赴大唐的东都洛阳向唐高宗表示臣服，并表示倭国愿将倭国的九州岛交给大唐管理，倭国永远不再与大唐为敌、永远臣服于大唐，唐高宗大喜，重赏了稻田明哲，并设宴招待稻田明哲，稻田明哲说：“谢主隆恩！皇上今日对我的重赏和为我设宴，我永远不会忘记！”
公元664年二月初五，大唐高僧玄奘病重，唐高宗得知玄奘病重的消息后派御医前往玄奘所在寺院去给玄奘医治，但当御医还在半路上的时候，玄奘就去世了，唐高宗为之废朝数日，前后五下敕书为玄奘置办丧事，用金棺银椁收敛玄奘。
公元664年四月，卫州刺史李元庆病逝；魏州刺史李孝协因犯贪污罪被唐高宗赐死。
公元664年五月，遂州刺史李孝病逝。
公元664年十二月十一日，唐高宗因武媚娘过于强势，经常制止自己想做的事，所以有了废掉武媚娘的皇后之位的想法，上官仪非常赞同唐高宗的这个想法，于是，唐高宗便让上官仪草拟废掉武媚娘的皇后之位的诏书。
唐高宗的内侍看到唐高宗让上官仪草拟废掉武媚娘的诏书这一幕之后，慌忙把此事告诉了武媚娘。
武媚娘急忙赶到唐高宗的寝宫，此时，上官仪已经把废掉武媚娘的皇后之位的诏书草拟好了，并离开唐高宗的寝宫，武媚娘发现了那份诏书，武媚娘拿起那份诏书，愤怒的对唐高宗说：“这是什么？”唐高宗说：“是上官仪教朕这么做的。”武媚娘说：“上官仪其心可诛！”唐高宗说：“皇后，你想怎么处置上官仪？”武媚娘说：“本宫想把上官仪满门抄斩！”唐高宗说：“上官仪是一位能臣，如果朕把上官仪满门抄斩了的话，朝中文武大臣会议论朕的。”武媚娘说：“那本宫就找个借口让皇上有理由把上官仪满门抄斩！”
武媚娘说完便去找许敬宗，武媚娘对许敬宗说：“许大人，上官仪让皇上废掉本宫的皇后之位，幸好被皇上身边的内侍发现，皇上身边的内侍把皇上让上官仪草拟废掉本宫的诏书的事情告诉了本宫，本宫急忙赶到皇上的寝宫，发现了那份诏书，并使皇上不敢再有废掉本宫的皇后之位的心思，许大人，本宫想将上官仪满门抄斩，你明天去觐见皇上，你跟皇上说上官仪和被皇上贬为庶人的李忠以及宦官王伏胜准备谋反，皇上定会将上官仪满门抄斩，将李忠赐死，将王伏胜斩首，右相刘祥道、左肃机郑钦泰和上官仪的关系很好，本宫会让皇上罢掉刘祥道的政事，让皇上把郑钦泰流放。”
第二天，许敬宗去觐见唐高宗，许敬宗对唐高宗说：“皇上，上官仪和被皇上贬为庶人的李忠以及宦官王伏胜准备谋反，请皇上速速将此三人治罪！”唐高宗说：“上官仪、李忠、王伏胜犯了大逆不道之罪，朕要将上官仪满门抄斩，将李忠赐死，将王伏胜斩首。”
唐高宗说完便下旨将上官仪、上官庭芝父子全家、王伏胜捉拿入狱，于第二天行刑，将李忠于第二天赐死。
第二天，也就是公元664年十二月十三日，上官仪、上官庭芝、王伏胜首先被斩首，接着，上官仪、上官庭芝的家人们皆被斩首，李忠被赐死。
当天下午，武媚娘对唐高宗说：“皇上，上官仪虽然被满门抄斩了，但和他关系很好的刘祥道、郑钦泰还在，为了避免刘祥道、郑钦泰以后为上官仪报仇，请皇上罢掉刘祥道的政事，给他一个与政事无关的官职，把郑钦泰流放，皇上，本宫觉得光把郑钦泰流放还不足以除后患，本宫认为，凡是和上官仪有过来往的大臣都应该被流放。”
唐高宗不敢违背武媚娘的想法，便罢掉刘祥道的政事，给刘祥道封了一个与政事无关的官职司礼太常伯，把郑仁泰流放岭南，其他和上官仪有过来往的大臣则皆被唐高宗流放到黔州，被唐高宗流放到黔州的大臣共计三百个。
当天晚上，武媚娘对唐高宗说：“皇上，从明天开始，本宫想和皇上一起上朝，垂帘听政，帮皇上处理政事，皇上同意吗？”
唐高宗不敢不同意，唐高宗便对武媚娘说：“皇后能和朕一起上朝，帮朕处理政事，这太好了，朕当然同意了。”
