把史为训扔出去后，秦雄还心怀侥幸，以为小红只是被史为训捂死的，与他没有干系，陆沅芷的誓愿只会惩罚史为训，不会对他有什么影响。但是好景不长，刚把史为训扔出去不久，秦雄的身上脸上也开始痒了起来，看了下身上裸露的部位，皮肤已经发炎溃烂。他一边抓挠一边痛苦的嗷嗷直叫，家人们忙去请医生，但来来往往请了无数的医生，用了无数的药，他的皮肤溃烂和痛痒都不曾有一点减轻。在痛痒的折磨下，他每天如杀猪一般拼命嚎叫，凄厉的叫声让府中仆人个个感觉心惊胆寒、汗毛直立。
陆沅芷化鱼飞天的消息在皇都迅速流传开来，因案子发生时，舆情太过强烈，监斩官在斩了陆沅芷后，也写了监斩现场情况汇报书呈报给了皇上，为了避免皇上震怒，他在呈报书中去掉了三年内皇都城破这一句。皇上见报极为震惊。竟亲自召来朱万宝询问。朱万宝一直想找机会向皇上奏报他对秦雄的怀疑，但却因官职太小，一直难见君颜，这次皇上召见，他就是拼了性命，也要请求皇上一定要派人查出真凶。
在皇上的面前，朱万宝拿出他特意收藏的杜宇飞为陆沅芷写的辩驳书，并根据辩驳书上的事实描述，讲出了那天他给小红烧纸后梦中见到的情景。皇上听罢，立刻派人四处去寻找杨安国，又派人去京兆府查看秦雄是否生病。派去京兆府的人很快回来，说秦府尹果然莫名生了怪病，每天因疼痛挠痒发出的嚎叫声可传出数条街巷。
皇上听后点头说：“果然是冤案。”然后责成大理寺调阅卷宗，重新审理此案。没有了舆论的压力，又加上陆沅芷含冤化鱼后对当事人产生的震慑，案子的重审进行的很顺利。杨安国很快被找了回来，他的供状直指秦雄和史为训，大理寺办案人员又根据刘源等人呈送过来的陆沅芷被抓前写给他们的信，从空谷观方丈室中拿到了秦、史两人的衣带，坐实了证据。秦、史两人已被身上的脓疮折磨的生不如死，所以被提审时都对犯罪事实供认不讳，他们只盼望尽早被处决了好能得到解脱。史为训因杀人和恶意传播不实消息，以致造成严重后果的罪名，在他被脓疮折磨了两个多月后被判了斩刑。杨安国因调唆别人犯罪而被判流放广西，在去往流放地的途中遭遇叛军，被叛军杀死。秦雄也希望能如史为训一样早早被斩了，那样就不用再受脓疮带来的痛痒折磨，但他却没那么幸运，因为以刘源为首的一些官员，又以秦雄依仗其父秦收之势，卖官鬻爵、鱼肉百姓之罪名对他和秦收进行了弹劾，为此他不得不继续苟活着以配合大理寺的调查。办案人员在抄秦收的家时，抄出了大量的奇珍异宝和金银玉器，钱财多到连皇帝都叹为观止。弹劾的证据一经查实，秦收被免去了丞相职务后被贬做了端州司马，在赴任途中，又接到皇帝削去其所有官封，流放驩州的圣旨。于是秦收又改道驩州，刚到没多久，就又收到皇帝赐其自尽的圣旨。于是不得不在驩州自尽了事。秦雄在等案件调查结束后，被叛了秋后问斩，但还没等到刑期就因脓疮暴发，死在了狱中。
目睹了杀害小红并嫁祸陆沅芷的凶手都受到了应有的惩罚后，已对险恶难测的人生感觉心灰意冷的朱万宝背起他的琴进了终南山，从此就消失在了茫茫崇山林海之间，再没有了他的消息。
方群玉在把陆沅芷的灵柩安放到空谷观后，就辞别了杜宇飞，南下四川去寻找他的家人。在西川节度府，他遇到了吴维信和已与香蕙成了亲的崔若曦，在吴维信和崔若曦的撮合下，他又纳了一直喜欢他的横波为妾，从此过上了安定幸福的生活。方凌云夫妻因苏氏和陆沅芷相继的去世，也都不再嫌弃横波低微的出身，欣然接纳了她。后来西川节度使建立蜀国，方群玉、崔若曦、吴维信三人都分别成了蜀国的重臣。崔若曦还一度做了宰相。
陆沅芷含冤化鱼后，空谷观的香火又好了起来，当地人都说是陆沅芷已得道成仙，所以才会化鱼进入了天庭。她的灵柩在空谷观停放一年后，被下葬在空谷观的方丈室旁。周围十里八乡的民众都来她的坟前烧香祭扫，以期求得她的保佑。特别是那些曾经在促成她冤案时误信误传谣言的人，更是常来她坟前忏悔，请求她的宽恕。冷香在朱万宝遁入深山后，也来空谷观出了家。空空子羽化后，暖香接任她成了空谷观的住持，冷香则做了监院，在她们的主持下，空谷观又空前发展，春花、秋月、夏雨、冬阳则都成了观里的四大执事。
秦雄和史为训的死，又在皇都引发了一场惊恐和骚动，有人说陆沅芷发下的第三个愿已实现了两个，最后只还有个城破人亡的愿望，只怕不久也会应验。也有心存侥幸的人辩驳说史为训是杀死小红的主要责任人，他是被斩的，并不能算是陆沅芷愿望的实现。但更多的人更相信秦雄才是小红死亡的主因，不过是假史为训之手而已，秦雄已在陆沅芷发愿的一年内受脓疮之痛的折磨而死，史为训被斩前也得了脓疮，如果不被斩首，或许用不了太久，也会因脓疮暴毙。人们在这两种观点之间摇摆，也就在要不要抛家舍业提前逃命这件事上摇摆不已。
送走方群玉后，杜宇飞接到一个关于他弟弟杜宇皓的噩耗。因当时身为徐泗观察使的颜曾不体恤士兵疾苦，士兵的怨气很大，而当时因南诏攻打交趾、桂林，徐泗地区派二千人前去增援，其中八百人驻守桂林，按惯例驻守在外增援的驻军应每三年轮换一次，以便使驻守的士兵回家乡休息。但到该换防时，颜曾以“军帑匮乏、难以发兵”为由，拒绝为前军派兵换防，由此引发前军将士愤怒，发动了哗变，哗变者杀死了驻军的都头，开兵甲库取了兵器盔甲，又在附近抓大量壮丁充入到自己的队伍中。然后一路装神弄鬼，连骗加打回到了徐州，杀死颜曾后，叛军要求杜宇皓帮他们写奏章，请求皇帝封叛军首领为节度使，杜宇皓慨然拒绝，结果被叛军杀死。消息传到皇都后，皇上下诏追赠他为兵部郎中，并对其家人进行了嘉奖，杜宇飞也在受奖之列，但所有的奖赏都无法补偿失去亲人的痛苦。杜宇飞在听说了杜宇皓的噩耗后不久，就因心痛而去世。临死前他让杜宪带着孩子家眷早日离开皇都这是非之地。于是杜宪在安葬了杜宇飞后，亦带着妻子母亲离开皇都去了四川。后来杜宪的两个儿子也分别在蜀国做了国君的常侍。杜宇飞死后，他的灵魂亦化成了杜鹃鸟，孜孜不倦的飞翔在每一个有他亲人和故交的地方，看望他们，啼叫着为他们做各种提醒。
杜宇皓死后没多久，徐州的哗变也很快被镇压了下去，但这次的镇压让朝廷损失了数十万的士兵，耗费的钱粮更是不计其数。刚镇压完徐州哗变，全国各地又发生了许多农民起义，其中一股最强大的起义军攻破皇都，皇上仓皇中带人逃往四川，农民军大肆在城中烧杀抢掠。城中无数居民丧生。后在各地节度使的派兵围剿下，终于把农民起义镇压下去，但也造成本已拥兵自重的节度使更加跋扈，不把皇帝看在眼里。后来各地节度使纷纷建国称王，旧的王朝破灭，在不断的动乱和争夺土地的战争中，新的王朝在悄悄孕育……
