马烬在和娜姿进行了四年的旅程之后便回到了真新镇，继续和大木博士以及花子姐姐做着邻居，成为了大木博士的助手，并且在第五年的时候靠着伊布的不同进化方式，成为了联盟认可的最年轻的博士，而马烬也做着小茂和小智的知心大哥哥。
而娜姿也是跟着马烬一起回到了真新镇，此时的娜姿眼里只有马烬一个人，马烬强大的实力已经让她倾心，只是马烬心里已经有了苏小狸，所以拒绝了她，但是娜姿也是不放弃，一直跟着马烬后面。
而马烬再和娜姿一起游历整一个精灵世界的时候，两者都闯出了偌大的名号，一个被称为年轻一代最强训练师，另一个则是被称为世界第一超能力者，马烬在游历这个世界的时候，已经连着一些小岛和一些山脉加上这里面的小精灵，全部移动到了自己的小世界之中。
马烬和娜姿在挑战各地的同时，也在不断的扩充着自己的小精灵数量，马烬把目前联盟已知未的各种不同的小精灵全部收集了起来，而娜姿则是把大部分强力的超能力小精灵全部收集了起来，有一点弱的都不要。
马烬捕获的这一些小精灵，全部放入小世界之中，小世界之中科学家和小精灵世界之中各种被马烬克隆出来的科研人员，一同改良了小世界完整的基因复制系统，开始对各种小精灵进行了基因复制，马烬捕获的这些小精灵数量种类都是极其的负责，就连迷你龙等亚神兽马烬也是捕获许多。
而马烬自己的小精灵不是经过大蛇之力的洗礼，就是成功接收那符文之力的能量，至于失败者，对不起，这里没有失败者。
马烬再集齐自己的六只精灵之后，便是回到了常磐市，和此时的常磐道馆馆主坂木进行了斗争，而坂木不负马烬的期望，击败了马烬的两只神奇宝贝之后，被马烬的王牌——成功进化的哥达鸭一举击破。
马烬除了之前的比雕，黑色暴鲤龙和他的哥达鸭以外，他的主力精灵多了由水晶大岩蛇进化之后可以MEGA进化的大钢蛇，以及等离子队打造的最强猎手赤红的盖诺赛克特，和火箭队打造的并且目前可以MEGA进化的超梦！
但是任谁都没有想到这个所谓的知心大哥哥，联盟最年轻的博士，以及年轻一代最强的训练家竟然是在暗地里与联盟分庭抗争的天启集团幕后Boss。
而这个天启集团则是明面上则是利用资金或是各种拉拢（多数为靠着马烬娜姿修改记忆）聚集了各个种类不同的科学家，科研人员进行各种科研项目，他们的产品分布在世界各地，而且一些特别重要的东西，也只有他们这边才能生产，而这个世界个个的财团也和他们交接，平常普通的民众也离不开他们的各个产品。
但是在暗地里则是同样聚集了各个地区的精英犯罪团伙或者是遭受联盟打压的强力训练家，他们以板木等各地区最强的犯罪团伙为主，对联盟各个地区的认可道馆和各处警备组织进行了各种袭击，联盟虽然强大，但是受袭地区太多，根本来不及应对。
久而久之，有一些比较偏远的地方就直接投靠了坂木他们的势力，这些地区在联盟地图上被称为黑暗区块，而各个地区的联盟，因为这一些黑暗区块被完全的隔开了。
虽然联盟可以强行打击一方，但是这些人数太多了，而且有很多都是因为大蛇之力，变得实力非凡，一般的联盟训练家都没有用，而派遣的精英级别的训练家过多，这些犯罪集团就会对被抽调人员的地区再次进行袭击。
而坂木等人则是因为马烬小世界之中那些超级科研人员，根据这个世界科技所制造的那些堪比大师球的精灵球，带着他们的手下，根据马烬所提供的信息对于那些究极异兽，以及一些三级神的神奇宝贝进行了捕捉。
（总不能按照游戏里面的数据说话，我是按照他们的能力进行分等级的，比如莱希拉姆捷克罗姆两个是二级神，酋雷姆是一级神，那么焰白酋雷姆暗黑酋雷姆两个就是超级神，此外三神鸟这种就是三级神，然后创世神就是至高神。）
闪电鸟，急冻鸟，火焰鸟，雷公，炎帝，水君，雷吉洛克，雷吉艾斯，雷吉斯奇鲁，九只三级神，被坂木的火箭队所抓到了，但是马烬和他们的目标可不是这些啊，而是他们的主神洛奇亚，凤王和雷吉奇卡斯！
马烬此时的小世界已经很是强大了，但是还不是最强盛的时候，这个小世界属于马进的时候，在本源世界，这个小世界足足拥有着银河系的大小，而马烬这里目前只有着因为冉闵和符文的力量，才开启了两个地球的大小，现在马烬需要这些神兽的力量来加强自己的小世界，不过不是这些特级的神兽还是不要做为好，毕竟这个世界可是有着自己的意识！
马烬只是一直在做着支线任务，目前的马烬一共完成了十几个任务，而马烬则是在做任务的时候，让自己的可达鸭对战城都地区的水君，并且抢夺了它的神职，而马烬的可达鸭在夺取了它的神职之后则是进化到了哥达鸭，但是这个世界的世界意志和创世神阿尔宙斯都没有再去关注或是盯着马烬了。
马烬发现除了第一个任务是无理由的任务以外，其他的所有任务都是为了这个世界的发展而行动的，比如说是帮助这个世界更新他们的民用科技，然后还有什么击败天外来客代欧奇希斯等等，都是针对世界的不稳定因素或是发展这个世界所发布的任务，但是马烬却是一直没有领取到主线任务，若是没有领取到，马烬就真的要在这个世界呆满十年！！！
马烬和他小世界的科学家，已经把这个世界所有的科技都吃透了，而且还在不断的升级着，就连联盟内部的所有科技也是被马烬打包带走了，只是马烬在这个世界呆的更久，越发的觉得一种不舒服的感觉。
