到达崎岖山地与岩石中的安静城镇尼比市之后，加尔文本想直接去挑战尼比市的道馆训练家小刚的。结果，却被小娜拉着去了尼比市西北边的科学博物馆。
“阿文你知道吗？尼比市的科学博物馆可是这座城市里最著名的景点啊！”走在前往科学博物馆的道路上小娜一脸俏皮的说道。
“啥东西都没有，还得交门票，我到现在还没有钱呢！”听了小娜的话后加尔文是一脸的黑线，内心中开始吐槽道。
到达尼比市科学博物馆之后，加尔文才发现自己错了，这个地真的非常的壮观，相较于游戏中的呆板，真实面对这个博物馆的时候，它的占地它的雄伟是让人挥之不去的，怪不得它能够成为尼比市最著名的景点。跟游戏中一样，交五十块钱进去，因为是小娜提议的，所以她很自然的就替加尔文一块交了钱，对此加尔文十分的尴尬，跟女生出来玩竟然让女生掏钱真的有些失败啊！
进入博物馆之后，小娜就从背包里掏出了相机让加尔文帮忙拍照，接过小娜递过来的相机，加尔文瞬间感觉脑袋大了整个人都不好了，前世的时候跟女生出去，替她们拍照的时候不停地被吐槽直男，弄得加尔文都有些心里阴影了，但是好在小娜并不在乎，因此参观进行的很顺利，但是当走到存放化石的房间时，加尔文突然发现自己掉进了一个诡异的墓穴里。
墓穴的布置跟寻龙诀电影开始的时候差不多，是一扇古朴的大门，大门边上站着一群凶神恶煞的守卫，守卫不是人而是一群化石神奇宝贝中最为凶残的镰刀盔。不过那些凶残的镰刀盔好像对加尔文没什么敌意，不仅主动给加尔文让开了道路，而且替加尔文打开了墓穴的大门。
大门打开后跟那些奇幻小说一样，先是一阵刺眼的光芒让加尔文睁不开眼睛，接着光芒散尽之后加尔文看到的是一尊巨大的石像形似麒麟，但是那尊麒麟雕像并不完全，好像缺了点儿什么东西似的，并且它的身体被铁锁缠绕着，好像被封印了似的，然后看着眼前的景象加尔文竟然不自由自主的靠了过去想要抚摸那尊雕像。
“住手！”这时候只听一声叫喊，一个身着博物馆工作服的男人跑了过来，一把夺过了加尔文手中的化石，而加尔文也因为这一声叫喊瞬间惊醒了过来。
“不好意思，我刚才观察化石有些入迷了。”这个时候如果不赶快道歉装的自己是一个狂热的化石迷爱好者的话肯定得被工作人员给赶出去，因此加尔文是立刻急中生智道。
“你是入迷吗？明明是石乐志了！”这个时候一旁的小娜是对着加尔文翻了一个白眼，心想道“加尔文怎么自从跟莲二对战之后就有些不正常来呢。”
“恩？”那个工作人员发出了一声质疑声的嗯。
“你手中的这块化石是菊石兽化石。”这个时候加尔文是立刻开口道。
“何以见得啊？”听了加尔文的话后工作人员也是立刻反问道。
“你不会是在瞎扯吧！”这个时候小娜扯了扯加尔文的衣角低声说道，显然不太相信加尔文。
“首先是它的形状跟蜗牛差不多，其次你看这一块位置是不是跟菊石虫差不多，再来这边远有很多触手状的东西，最后就是这个大贝壳。”没有理会小娜的疑问，加尔文是不急不慢的向着工作人员解释道。
“唉！你这么一说还真是啊！哇靠，这是重大发现。”说着工作人员立刻叫嚷着跑开了。
“哇！好险。”这个时候加尔文也是倒吸了一口凉气道。
“还不都是你石乐志啦！”小娜愤愤的说道。
“要不是你非要来着能这样吗？”加尔文也是毫不示弱道。
“你你，你混蛋。”这个时候小娜显然有点儿生气了，竟然这几爆粗口了。
“对不起，对不起，我错了，我们先离开这儿吧！”这个时候加尔文也是意识到不能跟小娜斗嘴了，万一被那个工作人员留下来，那么自己不得好好给他们解释解释这个化石的由来，要是自己再一激动把化石山谷所在地抖露出来，那自己捕捉化石翼龙的计划不就得泡汤了吗，因此三十六计走为上计，加尔文是立刻拉着小娜如风一般离开了博物馆。
从博物馆逃离之后，加尔文对于刚才自己突然失去意识感到十分的好奇，就像小娜询问道，小娜告诉他，也不知怎么了他在进入那间房子之后就突然进入了一种顿悟的状态，不管小娜怎么叫他，他都没反应而是一直往前走，然后去掏了博物馆的化石。
“恩？”听了小娜的话后加尔文也是有些懵逼，这到底是什么情况啊！
“你难道没有意识吗？”对于加尔文的反应小娜也是有些疑问道。
“走吧！先去神奇宝贝中心吧！”加尔文不想再过多的纠缠刚才的事情，同时也需要好好理一理自己的思路，于是简单的回应了一句便开始朝着神奇宝贝中心走去。
“喂！等等我。”见到加尔文快步离去小娜也是喊了一句然后小跑着追了上去。
来到神奇宝贝中心恢复了一下神奇宝贝，然后将包放在房间里，加尔文觉得目前自己遭遇到的事情可能比穿越更离奇，因此必须找一个人来给自己答疑，而在这个世界学识最渊博自己最熟悉的一个人只有大木博士啦！
接通了大木研究所的视频电话，不过另加尔文震惊的是作为著名的神奇宝贝研究专家，大木博士的午餐竟然是泡面。
“阿文啊！你现在在哪啊？怎么突然想起给我打电话了呢？”电话那头的大木博士吃了一口泡面以后问道。
“我现在已经到达尼比市啦！最近这几天我遇到了一些问题，想听听博士您给的意见。”加尔文有些严肃的说道。
“什么问题呢？”大木博士喝了一口面汤以后说道。
“神奇宝贝的起源是从什么时候开始的呢？”加尔文问道。
“恩？”对于这个问题大木博士显然是吃了一惊，没想到加尔文会问这样的问题，连泡面也放在一边顾不得吃了，然后露出了一副比较苦恼的样子。
“传说神奇宝贝最初并不是人类的伙伴，而是一群妖怪，它们数量不多但是成群出现有一位妖怪首领，它们掠夺人类的食物，抢占人类的家园，反正传说中最初的世界是十分混乱的，但是后来出现了一位勇士手持神剑大战妖怪，据说总共屠戮了妖怪一千只并且斩杀了当时的妖怪首领，人类与妖怪才开始和平共处，也是从那个时候开始妖怪开始像帮助人类的神奇宝贝演化，数量开始增多也是源自那个时候。”大木博士的话里充满了沧桑的意味，好像那个时代他经历过一样。
“对了阿文，为什么会突然想起来问这个问题呢？”这个时候反应过来的大木博士也是追问道。
“自从上一次的朔日见识过发狂的小火龙之后，每当朔日前后我的记忆力总是出现一些奇怪的东西。”加尔文语气低沉的说道，“听了您的话后，我发现我好像参与了那个时代的大战。”
“别开玩笑啦！神话中的故事你怎么可能参与呢！”对于加尔文的回答大木博士面带微笑的回应道。
“那么阿尔宙斯和空间之神、时间之神、反转之神的由来您应该知道吧！”放弃了前一个问题加尔文继续问道。
“这个还是比较好为你解释的。”这个时候大木博士也是再次端起了泡面一边吃着一边说道。
“传言阿尔宙斯是从虚无之蛋中诞生的，有人说他创造了神奇宝贝世界，也有人说他只是创造了神奥地区，对此还是有很多争论的，至于那三神兽的话应该是他创造出来分管空间、时间以及反转世界的，除了这三只神兽以外三圣菇也是由他创造的。”大木博士手中端着泡面对于阿尔宙斯是一脸神往的样子。
“意志之神亚克诺姆、智慧之神由克希、感情至深艾姆利多。”加尔文喃喃道。
“原来连这三只传说的神奇宝贝你也知道啊！”对于加尔文能够知道这三只神奇宝贝大木博士很是震惊，刚要继续跟加尔文交流，却发现加尔文已经闪身离开了出现在画面上的小娜，简单的了解下情况之后，大木博士便挂断了电话。
此时大木研究所，一个神秘的房间里。
“难道他真的是命运之子，但是拥有上古血脉的人和神奇宝贝应该已经消失在历史的长河中了，阿文这孩子出现是个谜，他刚才问我的事情虽然有些匪夷所思，但是那确实是真的啊！”大木博士盯着一块儿上面有着奇怪文字的石碑喃喃道。
从大木博士那里得到了一些想要的答案之后，加尔文也是从乔伊小姐那取回了神奇宝贝球，带着小娜去了尼比道馆，走进黑漆漆的道馆站定之后，道馆的灯突然打开了，馆主小刚就站在对面。
“你好，我是真新镇的加尔文，我想请你跟我做一场道馆赛。”看着眼前这个一脸正直的青年加尔文开口道，因为现在小刚的样子根本无法跟动画中那个好色青年联系在一起。
“你获得神奇宝贝多久啦！”小刚开口问道。
“一个月零三天。”加尔文淡淡道。
“这段时间正是你的神奇宝贝最可爱的时间，我觉得你应该好好享受它们的可爱。”小刚说道。
“但是作为一名道馆训练家我觉得你应该不需要关心这些吧！”加尔文此时回怼道，因为他实在是没想到小刚竟然这么婆婆妈妈。
“不听劝告吗！”小刚轻笑道。
比赛规则是2v2，场地是石之场地，这些规则从动画中加尔文已经知道了，当小刚说完规则的一瞬间加尔文便派出了神奇宝贝是小锯鳄。
“你还真是心急啊！”见此情景小刚也是有些无奈，不过也是立刻叫出了自己的神奇宝贝是大岩蛇。
尼比市的第一场道馆赛就在小锯鳄和大岩蛇之间展开了。
