台湾当局不仅希望能够有效地对付对方来袭的各种超音速导弹，而且时刻梦想着“境外决战”，为此它感到原有的武器装备实在是难以满足要求，已装备部队的两型“雄风”舰舰导弹的射程都太短，而且都是亚音速，其作战能力极其有限。所以，从1996年起，台湾“中山科学院”又开始研发“雄风”-3型舰舰导弹。
然而，在很长一段时间里，力图依靠自身的技术来研制“雄风”-3型舰舰导弹的进展始终不大。直到美国政府宣布单方面退出《反弹道导弹条约》之后，台“中山科学院”才有机会从美国和以色列获得了一些关键技术，从而推进了“雄风”-3型舰舰导弹的研制进程。
1998年，“雄风”-3型导弹试验弹首次试飞成功。1年后，“雄风”-3型导弹又相继完成了“超音速自由飞行、巡航后俯冲、模拟攻舰低-高-低弹道飞行、超低空掠海飞行”等多项试验飞行。在2001年4月举行的“汉光17号”军事演习中，台军在屏东县的九鹏导弹试射场对“雄风”-3型导弹进行了首次实战试射。
“雄风”-3型舰舰导弹上使用了台湾“中山科学院”研制多年的冲压式发动机，它的飞行速度是使用涡喷发动机的“雄风”-2型导弹最大飞行速度的2倍以上，导弹射程超过500千米。
“雄风”-3型导弹的速度能达到2.5马赫，射程达到数百千米，其中选用冲压式发动机起到了关键作用。为了选择一型合适的冲压式发动机，台湾军方可谓煞费苦心，逐一对比了多种冲压发动机：
第一种是液体燃料冲压火箭发动机。这种发动机历史悠久，技术成熟，但存在液体燃料流量调节系统结构复杂，大攻角飞行时容易熄火等不足。
第二种是固体火箭冲压火箭发动机，这种发动机的贫氧固体燃料经预燃气化生成富燃燃烧产物，排入冲压燃烧室，与从进气道引入的空气混合补燃，二次燃烧产物从喷管排出，产生较强的推力。
第三种是固体燃料冲压发动机，外部空气通过进气道经激波压缩后，直接引入冲压燃烧室贫氧固体燃料药柱的内孔通道，经补燃室充分燃烧后从喷管排出，产生推力。这种发动机具有燃气流量调节能力，结构简单，优点和功能均有所提高。
显然，“雄风”-3型导弹的试射成功，使得台海军急于尽早将其装配到“成功”级护卫舰、“康定”级护卫舰，以及即将购入的“基德”级驱逐舰之上。但也有消息说，由于“雄风-3”型超音速导弹体积较大更适合设置于岸上，而无法像现役的“雄风-2”型导弹那样部署在前两级护卫舰上，所以只能将其部署在“基德”级驱逐舰上。
但不管怎么说，“雄风”-3型导弹的服役，将主要有以下两个方面的优点，且其作战功能有相应的提高。
优点之一：抗干扰能力增强。“雄风”-3与“雄风”-2外形上的最大不同之处是，导引头鼻锥罩部分为尖锥形，能有效地降低阻力。“雄风”-3型导弹的末制导采用与“雄风”-2型基本相似的制导方式，即主动雷达寻的加红外寻的的末制导方式；此外弹上又增加了GPS导航系统接收机，能够自动及时地修正导航数据，具有较强的抗电子干扰能力和地貌识别能力，命中率相对较高。
优点之二：射程明显增大。“雄风”-3配备了“擎天计划”所研制的冲压发动机，采用楔形冲压进气口，无弹翼，装有4片X形尾翼，因此阻力十分小；其弹体比“雄风-2”长，增加了燃油量，因而最大射程增加到500千米以上。
“雄风”-3型导弹的服役，将具有以下作战功能：首先，可以实施较远距离的对陆打击。目前，有些人将该导弹称为反舰巡航导弹，它的射程达500千米或更远，台湾海峡最宽的地方为220千米，最窄的地方为130千米。
从理论上讲，“雄风”-3型导弹从台海军战舰上发射后，足以威胁沿海大中城市、港口基地或重要设施，而且能形成对一定战略纵深目标的打击能力。但鉴于台军的探测手段不多，其现有驱护舰的舰载雷达作用距离又十分有限，探测目标和获取信息，必须依靠台湾的E-2T预警机或舰载直升机为导弹提供信息或中继制导，但如此一来这些平台极易被对方搜寻发现。
其次，可以攻击对方的水面舰艇。“雄风”-3型导弹具有掠海超音速攻舰能力，最大飞行马赫数为2.5，每秒种可以飞行约0.83千米。从海上发现目标到击中目标，只需要几十秒的时间；即使对方水面舰艇装有“宙斯盾”防空系统，也只有20-30秒的反应时间。该导弹对于对方防空能力不足的舰艇，还可以进行大批量发射，实施多方位的饱和攻击，从而使其具有“反制”大型水面舰艇的能力。
第三，能产生不小的威慑能力。“雄风”-3型导弹的射程在500千米以上，且机动性较好，隐蔽性较佳，性能颇为出色，因此载有这种导弹的作战平台，无论是海上，还是空中的，均易给对方造成相当大的心理压力，形成一定的震慑作用。台军声称，其威慑范围可“到大陆浙江、福建以及广东一带。”
台军的目的就是想证明，其有先进武器可以打到大陆，一方面为“台独”分子壮胆，另一方面也想“吓阻大陆”。下一步，台军将加紧发展该型导弹，并在此基础上发展一型射程更远的地对地导弹，以增强其“决战境外”和“先发制人”的反击作战能力。
