亚历山大是率部从陆路翻山越岭来的，但却选择从水路返回，这是亚历山大预定的计划，他要趁回归之便，征服和控制波斯湾。不过，他的部下可能也乐意从水路返回，对于那些跟随亚历山大来的马其顿人来说，来程太可怕了。他们一路所遭受的磨难，特别是翻越兴都库什山时那种死里逃生的情景，令他们不寒而栗。为了从水路返回，在希达斯皮斯河已准备了80艘三十桨大船和许多运输船、轻型船，加上在当地征集的船，总共有千余条，由从马其顿赶来的海军司令尼阿丘斯率领。亚历山大把全军分成三路，一路由克拉特拉斯率领，沿希达斯皮斯河右岸行进；一路由赫斐斯申率领，沿希达斯皮斯河左岸前进，这是人数最多、实力最强的一路，200头大象也在这一路；他自己率领包括所有的近卫军在内的一部分军队乘船顺流而下。希达斯皮斯河流入阿塞西尼斯河，阿塞西尼斯河流入印度河，印度河直通大海。亚历山大和他的部下可能都认为，走这条水路是畅通无阻、一帆风顺的。他们谁也不会想到，这是一条充满危险的可怕的路。亚历山大还命令印度河以西的总督、他的堂兄菲利普在大军出发三天后率部跟进。
公元前326年11月的一天黎明，舰队开始起航了。亚历山大按惯例祭神，并按照占卜师的建议祭祀了希达斯皮斯河河神。他登船后，站在船头用一只金杯把酒洒向河里，祈求河神保佑，然后又向赫拉克勒斯、阿蒙以及他经常祭祀的那些神酹酒祭奠。做完这一切，他才下令号兵吹号起航。号角声中，庞大的船队井然有序地启动了，辎重船、运马船和各种战船都按事先安排的顺序向前驶进，船和船之间保持着一定的距离。河中，千帆竞驶，百舸争流，场面空前壮观，成千上万的桨板一上一下的击水声，水手的号子声、歌声，组成了一个不同寻常的交响曲。两岸挤满了送行的、看热闹的人，他们成群结队、载歌载舞地跟着舰队行进，走了很远才恋恋不舍地停了下来，目送着舰队在远处消失。
亚历山大和他率领的部下就这样兴高采烈地在河上航行。第三天，来到原定的赫斐斯申和克拉特拉斯所率部队宿营的地方，舰队靠岸停泊。三路大军在这里会合并停留了两天。当随后跟进的菲利普率部来到时，亚历山大对下一步的行动作了布置，他令菲利普率部到阿塞西尼斯河去，然后沿河前进；赫斐斯申和克拉特拉斯仍按原定路线前进，他自己也仍按原计划乘船顺流而下。
亚历山大一路顺利，河道也愈来愈宽，遇到可以停泊的地方，舰队就靠岸停泊，补充给养。一路还接待了不少沿岸主动归顺的印度部族，也有一些是抵抗失败后才投降的。当亚历山大接到报告说，前面的马利亚人和欧克西德拉卡人是这一带人数最多、最好战的部族，他们已把老婆、孩子转移到城里，准备和亚历山大大打一仗时，他立即下令舰队全速前进，以便在那些印度人还没作好充分准备时赶到，打他们一个措手不及。船队在亚历山大的催促下，第五天就到达了希达斯皮斯河和阿塞西尼斯河的汇流处。出人意料的是，两条大河汇合后，成了一条狭窄的水道，但流速却因河道变窄而大增。河水奔腾呼啸，形成许多可怕的大漩涡，掀起雷鸣般怒涛。亚历山大虽然事先已得到了这里河水险恶的报告，并已向部下通告了这一情况，船队到达这里时，水手们还是被惊天动地的惊涛骇浪吓呆了，停止了划桨，不知所措。驶入急流时，水手们才在舵手的指挥下尽力摇橹。船身短的虽仍被水流冲得打转，却还能沿一条直线前进。船身较长的双层排桨的大船，则被奔腾的浪涛冲得运转失灵，互相冲撞，有两艘沉没，不少水手落水卷入急流中淹死，甚至亚历山大乘坐的王船也在下沉，他只好跳入水中，奋力游上岸。幸好河道逐渐宽展，水流转缓，船队才避免了更大的损失。
船队靠岸停泊后，赫斐斯申、克拉特拉斯和菲利普都率部来和亚历山大会合，亚历山大又对下一步行动作了新的布置。他令尼阿丘斯率船队在陆上部队出发前三天起航沿河下驶，自己这次没有和船队同行。他把其余的部队分成三部分，赫斐斯申率领一部分先于主力部队五天出发；托勒密率领一部分在主力部队出发三天后再开始跟进；他自己率领部队主力前进。他这样安排是为了使他自己率领的主力部队中的人无法逃跑，因为逃跑者会被前后的部队抓住。这种情况说明，亚历山大的军心已严重不稳，因为防止士兵逃跑已成了行兵布阵都必须考虑的一个重要问题。军心不稳显然是因为士兵都渴望尽快回家，而现在亚历山大却要带领他们去进行新的征讨，而随军的印度士兵更不愿亚历山大率领他们去打自己的同胞。
2.以身犯险：激发战士的手段
亚历山大亲自率领主力部队，选择了一条敌人意料不到的路向实行自治的印度部族马利亚人进军，因为这条路要通过严重缺水的地区而且特别难走。当亚历山大来到马利亚人避难的第一座城市时，马利亚人根本就没有想到亚历山大会从这条路来，而且来得这样快，他们毫无准备，许多人都在城外，也没拿武器，被亚历山大突然袭击，毫无抵抗之力，没被杀死的，都急忙逃入城里。亚历山大立即令骑兵把城包围起来，等待步兵到来再攻城，同时派坡狄卡斯率领一部分骑兵去包围另一座城市，防止那里的敌人逃跑。步兵来到后，亚历山大立即攻城，印度人已失去了守城的信心，城池和要塞很快就被攻占了，要塞里的2000名印度人全被杀死，无一幸免。
坡狄卡斯赶到第二座城时，城里的居民已逃亡一空。坡狄卡斯随即率领骑兵对逃亡者进行追击，被追上者都被杀死。
亚历山大只让部队吃了饭，稍作休息，便连夜赶路，追击马利亚人。天亮时到达希德拉欧提斯河，见马利亚人正在渡河，就趁机打死许多渡河者，并迅速渡河追击已过河的马利亚人。马利亚人逃进一个有坚固工事的据点里，亚历山大一个冲锋就把据点攻下了，除打死的外，据点里的人全部被贬为奴隶。
亚历山大决心要征服全部马利亚人，当他听说有一些马利亚人逃到一座叫波罗门的城市里时，他立即率军赶去围攻这个城市。守城者进行了坚决的抵抗，马其顿人一时未能攻下。马其顿人已经厌烦了攻城夺寨，他们已没有了当初的争胜心，他们渴望的是回家。但亚历山大的战斗精神却有增无减，他身先士卒地第一个登上了城墙，冒着极大的危险，坚守在那里。马其顿官兵眼看主帅上了城墙，才心生愧疚，争先恐后地往城墙上爬，终于把要塞攻下。
亚历山大令部队休息了一天后，又开始追击其余的马利亚人。马利亚人实行坚壁清野政策，亚历山大所到之处，都是一座座空城，居民早已逃到更远的荒凉地区去了。亚历山大又令部队沿河搜索，把躲到森林里去的人抓住全杀光。亚历山大追到马利亚人的一个最大的城市，这里本聚集了许多逃亡者，但在得知亚历山大快来的消息后，城里的人又弃城逃跑了。马利亚人逃过希德拉欧提斯河后，停了下来，摆好阵势，准备依仗高陡的河岸，阻击亚历山大过河。亚历山大率领骑兵赶到马利亚人设防的地方，立即驱马涉水过河。马利亚人看到亚历山大率领骑兵冲过来，立即有秩序地阵形不乱地往后撤。亚历山大率领骑兵就追。马利亚人见亚历山大所率骑兵不多，掉头向亚历山大逼过来。亚历山大见敌人人多势众，队形严整，自己率领的骑兵难和敌人对抗，便和敌人兜圈子，不让印度部队靠得太近。当亚历山大的其他骑兵部队和步兵主力部队赶到时，马利亚人又掉头逃跑，亚历山大立即率兵在后紧紧追击。马利亚人最后逃进了一座设防的城市。由于部队十分疲劳，亚历山大没有立即攻城，而只是把城包围起来。
第二天，亚历山大下令攻城，但马其顿人战斗热情不高，动作缓慢，亚历山大十分生气，当他看到那些搬梯子的人有气无力、磨磨蹭蹭时，便夺过一把梯子，把它竖在墙上，一面用盾牌掩护着自己，一面迅速往上爬。只有三个马其顿人跟着他。亚历山大的近卫队看到他们的统帅几乎是孤身一人登上敌城、身陷险境时，慌忙蜂拥着也从亚历山大爬的那架梯子往上爬，结果把梯子压折了，爬在梯子上的人都摔下来了。此时，亚历山大一人站在敌人城墙上，成了敌人集中攻击的目标，亚历山大不顾一切地跳进城中，与敌人展开近身肉搏，和他一起并肩战斗的只有三个人。
亚历山大虽然勇猛，他的三名战士也舍命苦战，但终是寡不敌众，在敌人围攻下，一个战士中箭倒下了，亚历山大也被一支箭射穿了胸甲，扎入肺部，头上也被敌人打了一棒，虽负重伤，他仍浴血奋战，但终因流血过多，头晕目眩而倒下了。剩下的两个战士拼死抵挡着从四面八方射来的箭石，保护着他们的统帅。在国王陷身敌城、情况万分危急的时候，马其顿人被激起了誓死保卫国王的战斗豪情，纷纷冲上前去，用各种办法登城，跳到亚历山大身旁，护卫着躺在地上的亚历山大。城门也很快就被攻破了，马其顿的部队一股一股地涌进城里，战斗很快就成了一场大屠杀，印度人被斩尽杀绝，妇女、孩子也不放过。
亚历山大伤势严重，幸好找到一位医生，把箭从亚历山大身上取了出来，挖掉了伤口附近的肉，敷上了药，但由于流血太多，亚历山大身体非常虚弱，只能卧床休养。
亚历山大一生据说负过8次伤，这是最后的一次，也是最严重的一次。不少人眼见他昏迷着被从战场上抬下来，再没见他出现，营地里便流传开他已重伤死去的消息。全军陷入极度的悲伤中，哭声一片。在全军的心目中，亚历山大是唯一能率领他们摆脱好战的印度部族的包围、顺利返回故乡的人，失掉了亚历山大，就失掉了一切指靠和希望。他们虽已不愿再跟随亚历山大东征，亚历山大的威望和地位却是无人能取代的。后来传来消息说，亚历山大仍活着，但大家都不相信。接着又有人给大家送来了一封亚历山大的亲笔信，说他不久就回营地，大多数人仍不相信，认为信是亚历山大的近卫和军官们伪造的。军营里仍然人心惶惶。
为了安抚人心，避免部队里发生骚乱，亚历山大在身体稍微好些时，令人将他抬到船上，然后乘船顺流而下，来到部队营地。他叫人把船的天篷掀开，好让战士们能看见他。但部队仍不相信，认为船上运的是亚历山大的尸体。直到船靠近岸边，亚历山大向人群挥手致意时，他们才相信他们的国王仍然活着，便情不自禁地爆发出一阵欢呼声，有的高举双手感谢苍天，有的把双手伸向亚历山大，有的高兴得泪流满面。人们把亚历山大抬下了船，近卫给他抬来了一副担架，但他却要人把他扶上马。当大家看见骑在马上的亚历山大时，全军欢声雷动，经久不息。
亚历山大这次涉险负伤，受到了他的一些挚友的责备，他们说，这样狠勇冒险，是战士的事，不是一个统帅应当干的。他们的责备是对的，这件事，也暴露了亚历山大性格中的弱点，为了达到目的，他往往不顾一切，甚至把自己的安危都置之度外。当然，亚历山大也可能不只是逞个人之勇，他是想用自己奋不顾身的勇敢行动来鼓舞已日渐消沉的士气，但不管如何，作为一个统帅，孤身犯险，如遭不测，便会断送整个部队。不过，亚历山大却听不进他挚友的话，他已不能容忍别人对自己行动的指责。他身边已不缺阿谀奉承的人，有人见他听了责备他的话不高兴，便上前讨好地说：“亚历山大，见义勇为，此乃大丈夫。”这样的话，亚历山大感到十分中听。
马利亚人遭到沉重的打击，幸免于难的马利亚人不久派人来请降。欧克西德拉卡人的各城市和各地区的首领也来谒见，来谒见的还有其他一些重要人物，他们都带着贵重的礼物。他们提出投降的唯一要求就是继续让他们自由和自治。他们可以接受亚历山大派去的总督，也可以向亚历山大交贡赋。亚历山大让他们送1000名部族的优秀人物来当人质。他们答应了，不仅如数送来了人质，还多送来了500辆战车和车手。亚历山大留下了战车，却把人质打发回去了，任命菲利普为他们的总督。
3.婆罗门：无计可施的精神对手
亚历山大养伤期间，造了一大批新船，伤好后，又重新开始他顺流而下的航行。沿途继续接受一些部族的归顺，征服那些拒不归顺者，在战略要地建立新城市，留下一些部队驻守战略要地。亚历山大把阿塞西尼斯河和印度河的汇流处作为他堂弟菲利普辖区的边界，给他留下一支包括全部色雷斯部队、足够驻守全地区的部队，还命令他在两条河流的汇合处，修建一座城市，并在那里创建船舶修造所。
