十月秋，大秦长公子扶苏拨乱反正，囚二世胡亥并逆臣赵高等，登基为帝，改元初平，废二世，立号秦武皇，赦天下囚徒五十万归籍。废三公九卿制，设军政两院，立左右丞相，并六部尚书。诏告天下。
博士叔孙通主持登基大典，祭祀先庙毕，众臣分列两般，武皇端坐在阿房宫议政殿正中九龙座椅上。（早先秦始皇在章台宫处理朝政，扶苏将朝政尽数挪到阿房宫，改阿房宫前殿为议政殿。）武皇双目扫视群臣，一脸肃穆道：“司马欣，宣旨”。新晋为随驾御前御史的司马欣站在龙座下的台阶处躬身施礼：“诺”。然后面向群臣展开册封圣旨开始宣读。
“奉天承运，皇帝诏曰：封诸葛亮为左丞相，张居正为右丞相，李斯为政务院首辅。冯去疾为督察院首辅。蒙恬领大将军总督全国兵马。皆封侯爵。钦此。”五人出班叩拜谢恩。
然后是六部尚书和侍郎的任命。
：“封，房玄龄为吏部尚书，掌官员选拔，任用，调度职。杜如晦为侍郎。
封王安石为户部尚书，掌民生，钱粮，赋税职；贾思勰为侍郎
封寇准为礼部尚书，掌藩国交往，来往使臣，行科考选拔，交涉事项并一应典制礼仪之事。叔孙通，张骞为侍郎（扶苏征举）
封贾诩为兵部尚书，掌兵马，器具，粮草征募调度；军中武将功罚之事。冯劫为侍郎。
封狄仁杰为刑部尚书，掌法制刑狱之事。李纲为侍郎。
封蒙毅为工部尚书，掌工程建造修筑，一应器具打造研发之事。马钧，欧冶子为侍郎。
朝廷改军制度，设卫将军，掌管京都戍卫。暂设四镇，四平，四安将军。
封郭子仪为镇北将军，李广为平北将军，李信为安北将军统军十五万驻守上郡。
封王离为镇南将军，章邯为平南将军，李由(李斯之子)为安南将军。
封岳飞为镇东将军，张辽为平东将军，董翳为安东将军。
封周瑜为镇西将军。平西将军和安西将军暂时空缺。
另外封吕布为卫将军，坐镇京都，典韦为禁军统领，许褚为副统领，护卫皇帝和宫城。
镇北将军统兵五万，平北将军统兵三万，安北将军统兵两万，令有北地常驻军五万，共计大军十五万驻守上郡。
镇南将军，平南将军，安南将军共领兵十万驻守三川郡；镇东将军，征东将军，安东将军同样领兵十万镇守函谷关。
镇西将军周瑜本该统领十万大军驻守陇西郡。一则北地郡地广人稀，大秦军马场就在北地，有三万大军驻守，陇西更是老秦人久居之地，先秦遗族多在陇西，有他们为大秦镇守后房，朝廷很是省心。所以周瑜便留在咸阳。吕布同六部尚书封侯爵，四镇将军同侍郎，许褚典韦一起封为伯，四安将军封子爵。
秦武皇尊郑夫人为太后，居甘泉宫。封公子高为陇西郡王，扶苏让这个颇有才能的兄弟回老秦去安抚老秦那些贵族去了。原章台宫改名凤栖宫，将一众公主搬了进去。其余各宫不变。封屠炉和陈圆圆为贵人，在阿房宫中各赐宫殿居住。
当初扶苏拟订完官员名单时，蒙毅王离等建议仍旧让李斯冯去疾为相，以安老臣之心，扶苏力排众议，坚持启用新人，并且说：”国之丞相，在其位谋其政，当以身作则，为朝廷延揽人才，修订国策，使天下黔首受其所惠，要知道朝廷并非只是君臣之朝廷，更是天下人的朝廷，大秦也并非老秦人的大秦，更是所有黔首的大秦。两位老丞相为官多年必然深知以国事为重，原顾虑两位老丞相年事已高，本该让他们告老还乡颐养天年，无奈朝中诸事还需诸位老臣指点，所以就让老臣在后边指点晚辈们历练吧。”这一番说辞出啦，谁还敢再有意见？那意思分明就是指老臣们身处高位久居朝堂，已经看不到如今天下百姓身处水深火热的生活，体会不到民间疾苦了。原本该让你们都辞官归乡贬斥为民的，念在年事已高曾为国操劳的份上，就不收拾你们了，就老老实实看着年轻人努力把大秦变得富强起来吧。
任命完了朝中文武百官，首任刑部尚书狄仁杰就上书请旨，要宣判逆贼胡亥赵高一党，扶苏当即下旨，着督察员督察大臣冯去疾和刑部速速审理，整理罪证上报朝廷，择日拉去咸阳市口，举行万民公审。要让天下间的黔首知道朝廷对于乱政的逆党绝不姑息。只两日时间由督察百官之责的冯去疾连同刑部尚书狄仁杰就把胡亥赵高等连同心腹众人押解道咸阳市口，当着城中百姓的面宣读逆党的罪状，按秦律判了胡亥斩立决，赵高车裂，赵成闫乐腰斩，其余同党或弃市或流放为奴等等不一。谁知皇帝复旨，着改判胡亥凌迟，赵高历五刑车裂，闫乐赵成皆斩立决弃市，其余人等皆发配为奴，遣送北地羊马去了。
皇宫内侍寺人一道圣旨，责胡夫人教子无方，不曾劝谏，致使胡亥乱国，把她遣送到骊山为先皇守墓去了。
追封张熹为奉安伯，令其子袭爵。并令工部为各位朝臣在咸阳建造府邸。命丞相并六部商议修订国策，期间秦武皇在宫中召见新任户部侍郎贾思勰，工部侍郎马钧，欧冶子，礼部侍郎张骞等，一连两日昼夜不眠，直到第三日，礼部侍郎张骞请旨通西域，武皇准其所奏，下旨张骞带军士并工匠，奴仆总计一万余人出咸阳而去。而贾思勰马钧欧冶子等人自宫中回到府衙后闭门谢客，各自带着一帮属僚忙碌起来，只是时不时遣人招户部工部两位尚书要各种材料，比如精铁，硬木等物，把整个工部和户部忙的不可开交。秦武皇召见太医院医正李时珍，谈了半天，李时珍派遣太医院众吏目，带着皇帝分拨给的军卒，四处去延请名医，招募天下有学医兴趣的黔首乃至奴仆，前往由信宫改造的御医苑中学习医术；
数日后右相张居正朝堂之上上书，请求减免赋税，消减徭役，鼓励生育恢复人口，赦免囚徒奴隶。扩大吞田，奖励农耕，提高工匠和商人地位，扶助工，商等数十项政策。秦武皇从谏如流逐条同群臣修改商定。按照议程发付各部开始实施。并昭告天下颁布求贤令，无论文谋武略，凡有一技之长，不分士农工商皆可往位于咸阳城中正在修建的大秦学宫内接受朝官考核，考核通过的视其才能获取官职或者是奖赏。
这一连月余，昼夜不分，大秦新制定的一系列富国强兵的政令，开始自咸阳宫分发各地，渐渐实施起来。扶苏忙的焦头烂额，昼夜不分，仅月余时间足足瘦了一圈，朝中大臣看在眼里，更是憋足了劲的卖力工作，皇帝陛下勤政爱民，凡对提高国力有帮助的政策，事无巨细必定亲力亲为多方论证考教，确保最大程度的颁布实施，并行之有效的开展下去。朝堂上下一派欣欣向荣的景象。
可即便如此，不顺心的事情总还是会发生，而且还是一件大事，那就是眼下已经天下大乱了。
