石秀原籍为金陵建康府，专好打抱不平，江湖人称“拼命三郎”。后随叔父到北地倒卖羊马，不巧叔父中途病死而生意亏本，便流落到蓟州，靠打柴为生。
路见不平
一次偶然的机会石秀结识杨雄，当时杨雄被踢杀羊张保和两个小混混逼住，“动挥不得”，幸亏石秀出手把张保一伙全打倒了。
认识戴宗
石秀的出手惊动正好路过的戴宗、杨林。戴宗看石秀的功夫不错，有意接纳，试图为梁山招募石秀。于是戴、杨两人就拉石秀到酒馆里喝两杯。石秀知道了对方身份是梁山好汉戴宗、杨林。但是石秀婉拒了戴宗的请求，不过也为将来石秀上梁山打下了伏笔。
结拜杨雄
石秀帮了杨雄后，杨雄十分感激，有心结交，找到石秀，表达谢意。石秀知道杨雄的身份，于是就报出自己的家世，并说我这个人路见不平，就要舍命相助，所以人称拼命三郎。杨雄看石秀一表人才，又武艺高强、为人仗义，于是就建议结拜为兄弟。石秀欣然同意，遂与杨雄结为义兄弟。
与杨雄结交后，杨雄的老丈人潘公有家肉铺，而石秀祖上正好是干这一行的，于是潘公就让石秀来当这个肉铺的经理，石秀也就住在了杨雄家。
石秀捉奸
一次石秀买肉回来，发现肉铺歇业，原来是因为杨雄妻子潘巧云要给前夫做法事。
石秀
石秀看见潘巧云与和尚裴如海眉来眼去，已经开始怀疑，经过调查，不久石秀就识破了潘、海两人的奸情。石秀将此事就告诉了杨雄，并建议捉奸。
兄弟反目
没料到杨雄酒醉在巧云那里露了口风，巧云就反咬一口说石秀调戏自己。杨雄一怒之下就把石秀赶出了家门，收了肉铺。
翠屏山对质
于是石秀就先杀了探路的胡道，随后用胡道的木鱼声引出裴如海，把他也给杀了，然后将尸体剥光扔在马路上。杨雄心知肚明这是石秀干的，也猜到石秀说的基本是事实。于是杨雄向石秀道歉，并把巧云弄到翠屏山去质问清楚，杨雄将巧云和帮她安排通奸的使女迎儿给杀了。
投奔梁山
正当杨雄、石秀杀了潘巧云后商量上梁山时，时迁正好在一旁目击了全部过程，时迁要求同上梁山。于是三人同上梁山。
三打祝家庄
石秀三人投奔梁山时，途径祝家庄，这个时迁贼心不改，偷了人家店里报晓的公鸡吃了，结果时迁被抓。[4]
石秀，杨雄逃出后遇见杜兴，杨雄有恩于杜兴，于是杜兴向主人李应求情救时迁，李应爽快答应了，但祝家庄不肯放人，反而射伤李应，石秀于是上梁山求助于宋江，于是宋江决定攻打祝家庄。
祝家庄道路难走，于是宋江派石秀杨林探路，石秀不仅成功地从钟离老人那里探明了盘陀路的机关，而且还帮助陷入迷宫的宋江突围。显示了超强的情报工作能力。
不久石秀又假败、甘愿被卧底的孙立俘虏到祝家庄当内应，石秀为打破祝家庄立下了大功，从而也在梁山站稳了脚跟。
独劫法场
石秀、杨雄被派往大名府打探情况。燕青此时救下了卢俊义，但卢俊义还是被后面追捕的人抓走了。这时候，石、杨两人遇上燕青，当场决定杨雄同燕青回梁山求救，而石秀继续前往大名府关注事态的发展。
当石秀赶到大名府时，梁中书怕夜长梦多，决定将卢俊义立即就地正法。正当蔡福举刀行刑的千钧一发之际，石秀当机立断，孤身一人劫了法场。石秀人单势孤，虽然将卢俊义劫出法场，仍未能成功逃离大名府，结果自己也被逮捕。后来大名府被攻破，石秀也自然获救。
惨烈结局
梁山排座次后在第三十三位，星号天慧星
石秀在招安前对抗童贯、高俅的战争以及受招安后征辽、征田虎、王庆的战争中立下战功，最后在征方腊时，在昱岭关被乱箭射死。
这一部分的内容，版本的不同，有所差异，主要是在起源更早的百回本里无田虎、王庆情节，经过“腰斩”并增加“惊噩梦”情节的金圣叹评本无大聚义以后情节，而征田虎、王庆的具体过程在不同版本中也有所不同。
