建文帝犹豫了，两位都是辅阁重臣，两位都说得在理，如何取舍，他还须仔细斟酌。
建文帝思虑良久，才缓缓抬起头来，决然道：“齐爱卿所言极是，应当先削去那些势力不大的藩王，然后再集中精力对付不可一世的燕王。周王朱橚是燕王朱棣的同母兄弟，就拿他开刀吧！先断其手足，使其不能遥相呼应！”言罢即命黄子澄拟诏。
两日后，巡检使李景隆奉诏率锦衣卫奔赴河南周王府，将周王及其家眷全部拿下，押赴京城听候发落。
半个月后，建文帝下旨，将周王及其家眷贬为庶民，并命其举家迁至云南。
同年十二月，以“贪虐残暴”之名，将代王朱桂迁至蜀地圈禁起来。
翌年五月，建文帝又以“不法事”名，将岷王朱楄贬为庶民。
继而派锦衣卫以“私铸币”名缉拿湘王朱柏。
朱柏得知消息后，笑着对僚属说：“孤亲眼看到很多在太祖手中获罪的大臣，因不愿受辱而自杀身亡；孤乃高皇帝之子，怎能为求一条活路而甘受狱吏侮辱？”于是把家人召集起来，紧闭王府大门，点起大火，自焚而亡。其状之惨烈，令诸王胆寒。
紧接着，建文帝又以迅雷不及掩耳之势连续抓捕齐王朱榑和已圈禁在蜀地的代王朱桂，并将二王废为庶人。
建文帝使用雷霆手段在短时间内将诸王各个击破，取得了阶段性的胜利。在此期间，他的眼睛却始终盯着燕王朱棣。他深深地明白，所有的藩王都不足为虑，只有四王叔朱棣，才是他最可怕的对手。
建文帝朱允炆还清楚地记得曾经发生过的两件事：
一次，皇爷爷朱元璋出了一个上联：风吹马尾千条线。要求在场的朱允炆和朱棣对出下联，而且让朱允炆先对。朱允炆想了想，对道：“雨打羊毛一片膻。”此句虽然勉强对上，但却是不太雅。
而朱棣却灵光闪现突发灵感，脱口而出：“日照龙鳞万点金。”这一句不但对仗工稳意思贴切，而且还突出了一个“龙”字，显得大气而高贵，与皇子的身份十分相符，确属绝对。朱元璋龙颜大悦，当即对朱棣大加赞赏。而朱棣则鄙夷不屑地乜斜了朱允炆一眼，那意思是说，你小子也就只有这点能耐而已。虽然那时的朱允炆年龄还小，但却已经懂事，自然也明白那眼神的含意。
另一次，朱允炆从翰林院下课出来，在翰林院大门外正巧碰上朱棣。朱棣一看四下无人，便做出一副长辈对晚辈的居高临下之态，而且居然还用手拍了拍侄子朱允炆的后背，说：“没想到你小子也有今天！”那语气中既含有嫉妒、又带有威胁的意味，更有辱蔑、轻慢之意。
按封建规制礼仪，朱棣的这种行为实属大不敬，朱允炆也没有想到四皇叔朱棣居然敢如此放肆，他一时间竟不知所措。正在这时，朱元璋过来了，他看见如此情景，顿时勃然大怒，狠狠地训斥朱棣道：“允炆虽然是你的侄子，但他也是朕钦定的继承人，尽管他还没有继位，但你也应该把他尊为君主，你知不知道你刚才的行为就是图谋不轨、犯上作乱！按律当斩！”
朱棣顿时吓得魂飞魄散，赶紧跪下认错道：“儿臣只是玩笑而已，绝无轻慢之意，今后再也不敢了！”
从小在宫中复杂环境中长大的皇太孙朱允炆知道，叔叔朱棣长期镇守边陲，曾率领他的军队多次击败北方的入侵之敌。朱棣自恃战功赫赫，从没有把他这个皇位继承人放在眼里，而且一直觊觎着帝位。如果此时向皇爷爷告他的状，那么朱棣势必更加恨他。与其如此，倒不如在皇爷爷面前帮朱棣美言几句，以缓解相互间的紧张关系。于是，他赶紧替朱棣分辨道：“是孙儿在和叔叔闹着玩儿，皇爷爷要怪就怪孙儿吧！”
朱元璋这才暂息雷霆之怒，没有追究和处罚朱棣。
在朱元璋的眼里，朱棣是一个文武全才堪当重任的好儿子；可是在朱允炆的眼里，朱棣却是一个心怀叵测图谋不轨的坏叔叔。这倒也不矛盾，长期在宫中生活的人都具有两张面孔，朱棣也不例外，他一张脸是给父亲看的，另一张脸是给侄子看的。
建文帝朱允炆登基后，接连裁撤各藩镇诸王，这令朱棣心中阵阵发虚。他知道，建文帝接下来要对付的就是自己了。
在朱棣的眼里，朱允炆不过是个胸无韬略、年幼无知且乳臭未干的黄口小儿，既不能文又不能武，对社稷对朝廷无寸尺之功，这样的人怎么堪当重任继承大统呢？选择接班人也应该根据能力和功劳的大小来选吧！父皇不知是怎么想的，竟然选了这么个无能之辈！
朱棣曾经有过无限的期待，他相信只要凭能力论功劳来选择继承人，那么自己是很有优势、很有希望的。他一直认为，论处理政事和领兵打仗，谁也无法与自己相提并论！当然，宁王打仗也很厉害，不过他只是一介武夫，头脑简单而四肢发达，这样的家伙显然不能继承皇位。除了我，还有谁？然而，出乎他的意料之外，朱元璋对朱标的深厚的父子感情蒙蔽了他的眼睛，使他理智和感情的天平严重倾斜，在太子朱标去世后又选择了朱标的儿子、年仅十五岁的朱允炆为皇太孙。自己戎马倥偬出生入死半辈子真是白干了！
诚然，朱标优柔寡断，文弱怯懦、少韬略乏智谋，但到底是自己的大哥，长兄为父，论资排辈，心理上也还能接受，毕竟比自己早出生几年嘛。可那个十五岁的小毛孩居然也敢倚仗父皇的宠爱爬到自己头上来作威作福！这无论如何也难以接受，无论如何也难以服众！但是，这却又是无法更改的事实！如今父皇驾崩了，这个毛孩子成为了皇位的继任者，不管自己是否愿意，都必须跪倒在这小家伙的脚下，发誓效忠于他。他懂得什么？凭什么当皇帝？可是他又偏偏是名正言顺的继承人，他要把自己贬为庶民，自己就别无选择只能逆来顺受！因为“君要臣死臣不死不忠”，这是千古不变的规矩！自己该怎么办？天下是他朱允炆的，自己即使要逃跑，可又能逃到哪里去呢？
正当朱棣陷入对建文帝既不服又无奈、既不甘心俯首称臣又无法摆脱命运控制的复杂纠结的心境中时，他手下的谋士道衍窥破了他的心思，便趁机向朱棣进言，建议朱棣与其坐以待毙，不如拼个鱼死网破！并详细地分析了利弊得失和双方的优劣态势。
